Samtools merge 时出错：
弄了个软链接，如图2，使用链接过去的文件时出现图1的错误，主要是软链接的时候没有全部提供绝对路径。
出现以下错误，是因为事先没提前对bam文件进行sort,genomeCoverageBed中的输入文件同样需要经过排序，如若是bed，则须用sort排序，如若是bam，则用samtools sort进行排序。
Samtools faidx时出错：
出现以下错误是因为fasta文件中二号染色体和三号染色体间多出了一空行
