1. “病原体”概念误区
（https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MjM5ODU5NDgyMg==&mid=202942461&idx=5&sn=5ed9f25154e2d02e21c3000671c165a3&mpshare=1&scene=1&srcid=1029JhCTfkVFuQTahXg6jvU0&pass_ticket=GtY0YzRrk65m3d93rS%2FJLmjTBDHnHD2CGbXTmEn5b%2BBFy%2BAJzlXmZ69PEAPzbHsq#rd）
宿主与细菌的相互作用是否导致宿主损害及损伤才是致病与否的原因，而不应当只关注“病原体”。
有些细菌会产生一些毒素，所以找出这些编码基因，敲除，可以使其毒性减小（疫苗制备），但不是对所有都有效
而且有的疫苗会增加免疫反应，有风险（如肺结核：过度的免疫反应会损伤肺部组织）。
微生物对宿主的伤害可能是微生物的原因，也可能是宿主自身的反应，也可能两者皆是。
机体自身的正常成分，如细胞内的ATP、HMGB1等，如果大量释放到细胞外，也会引起免疫炎症反应。
2.
MWAS：Metagenome-wide Association Study
T2D（二型糖尿病）、CRC（colorectal cancer结直肠癌）、RA（Rheumatoid arthritis类风湿性关节炎）、肝硬化、动脉粥样硬化
3.
LEfSe差异分析：用于发现两组或以上的biomarker（Kruskal-Wallis秩和检验）