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  • 【IDDFS+剪枝】DNA sequence

    DNA sequence HDU - 1560

    题意:

    给定N个DNA序列(仅由ATCG构成),求能使得这N个序列均为其子序列的最短公共序列,输出这个最小的长度。

    思路:

    IDA*,估价函数即N个序列中未匹配个数的最大值。(因为最理想情况是,当前所尝试的字母X加入公共序列之后,能同时与这N个序列匹配)

    反思:

    先前不知道IDA*,当作普通剪枝做了,发现T了之后又尝试按字母贡献值从大到小来搜索,但并没有多大的优化,还是T。

    思路太直了,虽然意识到了“该序列未匹配的个数”的重要性,但还是大费周章地试图给每个序列每个字母的匹配情况做标记,也导致我在如何做标记、擦标记的问题上花了不少时间……

    以后想问题还是得有意识地抓住最关键的变量,不能局限在“好想”和“直观”上。

    int n;
    int mshort = -1;
    string alpha = "ATCG";
    
    struct node {
        string ch;
        int len;
        int filled;
    }DNA[10];
    
    int guess() {
        int tmp = 0;
        for (int i = 1; i <= n; i++) {
            tmp = max(tmp, DNA[i].len - DNA[i].filled);
        }
        return tmp;
    }
    
    int dfs(int len,string s) {
        //估价函数,估计还要填几个字母,依据是所有序列中单个序列未做标记的个数的最大值
        if (len + guess() > mshort) return 0;
        //如果不行,限制逐渐放宽
        if (!guess()) return 1;
    
        int flag = 0, tem[10];
        for (int i = 0; i < 4; i++) {
            //遍历四个字母
            flag = 0;
            for (int j = 1; j <= n; j++)
                tem[j] = DNA[j].filled;
            //匹配之前临时存一下已匹配个数,便于后续还原
            for (int j = 1; j <= n; j++) {
                if (DNA[j].filled<DNA[j].len && DNA[j].ch[DNA[j].filled] == alpha[i]) {
                    DNA[j].filled++;
                    flag = 1;
                    //标记 这个字母有贡献
                }
            }
            if (flag) {
                if (dfs(len + 1,s+alpha[i])) return 1;
                for (int k = 1; k <= n; k++) DNA[k].filled = tem[k];
                //还原
            }
        }
        return 0;
    }
    
    int main()
    {
        ios::sync_with_stdio(false);
        int t; cin >> t; while (t--) {
            cin >> n;
            mshort = -1;
            for (int i = 1; i <= n; i++) {
                cin >> DNA[i].ch;
                DNA[i].len = DNA[i].ch.length();
                DNA[i].filled = 0;
                mshort = max(mshort, DNA[i].len);
            }
            //迭代加深
            while (!dfs(0,"")) {
                mshort++;
            }
            cout << mshort << endl;
        }
        return 0;
    }
    
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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/streamazure/p/13376293.html
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