刚开始使用unity做开发时，拿到一个范例工程先上传SVN，之后再自己做一些修改后，发现有非常多文件都有变化，这才知道有很多本地生成的文件，是不用上传的，但是不知道哪些才是需要共用的。之后又困扰于修改提交时看不到diff，无法把握每次修改内容。在网上多方查找，找到以下几篇算是比较系统的介绍unity的文件介绍，翻译转载过来备忘
1、本文主要介绍工程文件结构，哪些目录、文件需要放在版本控制系统中。
http://developers.nravo.com/mastering-unity-project-folder-structure-level-0-vcs/#.U0yXvPmSyNw
2、.meta文件介绍
3、Asset目录下的系统保留目录
http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/ScriptCompileOrderFolders.html
从新建工程中查看unity文件系统
新建一个“test”的工程，导入“Standard Assets (Mobile)”这个包，新建一个"Tets.cs"的脚本文件，绑定到主摄像机上。做完这些后来看看生成的目录结构，如下图：
这么多文件和目录中，只有两个目录是需要放入版本控制中的：Assets 和 ProjectSettings。其他所有文件都是从这两个目录文件中生成出来的：
Assembly-CSharp-vs.csproj / Assembly-CSharp.csproj：
为C#脚本生成的Visual Studio和MonoDevelop的工程文件。
Assembly-UnityScript-vs.unityproj / Assembly-UnityScript.unityproj：
JS的工程文件
testproject.sln / testproject-csharp.sln：
IDE的solution，第一个包含c#、JS、Boo，第二个是纯C#工程，用VS打开，因为VS不处理JS和Boo工程
testproject.userprefs / testproject-csharp.userprefs：
MonoDevelop用来存放当前打开的文件、断点、监视点等信息的配置文件。
备注：
上面列出的这些文件中除了.userprefs外，其他文件都会在执行unity菜单Assets -> Sync MonoDevelop Project后重新生成
Assets：
所有游戏资源全都放在这个目录下，包括脚本、纹理、声音、自定义编辑器等。这是工程中最重要的文件夹
ProjectSettings：
存放工程设置。包括物理、标签、玩家设置等。换句话说，你在菜单Edit → Project Settings中做过的所有设置都放在这个目录下
Library：
重要Assets的本地缓存，不用放在版本控制中
obj / Temp：
unity运行过程中生成的临时文件。obj是MonoDevelop用的，Temp是unity用的
建立版本控制系统：
unity官方推荐开发者用unity原生的Unity Asset Server来进行版本控制。我们团队用了一个月之后，觉得这个原生本版控制不够强大，没有分支、锁定，要付费(团队牌照$500)，感觉像是个简化版的SVN。
之后采取的方法是将Assets转换为文本格式保存，用Git进行版本控制
assets转换为文本的设置（unity 4.3）：
1、Edit→ Preferences → Packages → Repository中设为External
2、Edit → Project Settings → Editor → Version Control Mode设为Hidden Meta Files（非必须）
3、最重要的：Edit → Project Settings → Editor → Asset Serialization Mode中设为Force Text，这里是选择用二进制还是文本格式保存。
4、保存配置
.meta文件介绍
当你在场景中引用一个资源(asset)时，unity不使用名字或路径，而用一个全局唯一的GUID来指向工程中的资源。这个GUID就放在meta文件中，unity会为Assets目录下的所有文件夹和资源文件生成一个meta文件。
GUID有优点也有缺点
优点：移动、重命名、改动资源文件，都对GUID没有影响，GUID还是指向这个资源文件。
缺点：注意不要随意删除资源文件相关的meta文件。如果删除了meta文件，unity会认为原始的资源文件被删除了，并给此资源重新生成一个新的GUID。这就是为什么有时候场景中资源的引用会突然断开。
除了GUID，meta文件还有重新导入资源的信息。比如纹理资源可设为以标准纹理、普通地图、GUI纹理、cookie、纹理、光照贴图导入。这些导入设置是放在meta文件中的。
Assets目录下的系统保留目录
http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/ScriptCompileOrderFolders.html
脚本编译顺序：
1、Standard Assets, Pro Standard Assets , Plugins 目录下的脚本
2、Standard Assets/Editor, Pro Standard Assets/Editor and Plugins/Editor 目录下的脚本
3、名字为Editor的目录之外的所有脚本
4、名字为Editor的目录下的脚本
Assets根目录下的WebPlayerTemplates 目录内的脚本不会编译。
比如一个UnityScript文件需要引用一个C#文件中定义的类。你可以将C#文件放在Plugin目录下，UnityScript文件放在一个非特殊目录下。如果不这样做，会提示C#类找不到。
http://wiki.unity3d.com/index.php/Special_Folder_Names_in_your_Assets_Folder
Standard Assets：其中的脚本最早被编译
Pro Standard Assets：与Standard Assets一样，是付费版的内容，比如纹理渲染、屏幕特效等
Editor：这个目录名字比较特殊（不一定在Assets根目录下），此目录下的脚本是unity编辑器的脚本API。如果你的脚本需要用到UnityEditor命名空间中的内容，就需要放在名为Editor的目录下。整个工程中可以有多个Editor目录。
备注：普通目录下可随意放置Editor目录层级，但在Standard Assets, Pro Standard Assets , Plugins这三个保留目录中则必须在根目录下。比如普通目录下为My Extension/Scripts/Editor，如果需要放在系统目录下则必须Standard Assets/Editor/My Extension/Scripts
Plugins：放置脚本使用的本地插件，编译时会被自动包含。必须放在Assets根目录下。Windows下的本地插件后缀为.dll，MAC下为.bundle，Linux下为.so
Resources：此目录下的资源可由脚本直接引用文件路径和名字，而不是常用(推荐)的直接引用(编辑器中拖放)。所以编译时此目录下的所有文件都会被自动包含(包括没有用过的资源)。工程中可以有多个Resources文件夹。不推荐在多个Resources目录下存放同名文件。一旦编译，所有Resources目录下的所有资源都会被一起打包。
运行时导入资源请参考官方说明http://docs.unity3d.com/Documentation/Manual/LoadingResourcesatRuntime.html
Gizmos：此目录下的纹理/图标用于Gizmos.DrawIcon()，按名字调用，在编辑器中绘制在屏幕上。
WebPlayerTemplates ：网页版，略过
Streaming Assets：Application.streamingAssetsPath中使用的资源，略过