一、当前用户专有的启动文件夹
这是许多应用软件自动启动的常用位置，Windows自动启动放入该文件夹的所有快捷方式。用户启动文件夹一般在：＼Documents and Settings＼<用户名字>＼“开始”菜单＼程序＼启动，其中“<用户名字>”是当前登录的用户帐户名称。
二、对所有用户有效的启动文件夹
这是寻找自动启动程序的第二个重要位置，不管用户用什么身份登录系统，放入该文件夹的快捷方式总是自动启动——这是它与用户专有的启动文件夹的区别所在。该文件夹一般在：＼Documents and Settings＼All Users＼“开始”菜单＼程序＼启动。
三、Load注册键
介绍该注册键的资料不多，实际上它也能够自动启动程序。位置：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼WindowsNT＼CurrentVersion＼Windows＼load。
四、Userinit注册键
位置：HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼WindowsNT＼CurrentVersion＼Winlogon＼Userinit。这里也能够使系统启动时自动初始化程序。通常该注册键下面有一个userinit.exe，如图一，但这个键允许指定用逗号分隔的多个程序，例如“userinit.exe,OSA.exe”(不含引号)。
五、Explorer＼Run注册键
和load、Userinit不同，Explorer＼Run键在HKEY_CURRENT_USER和HKEY_LOCAL_MACHINE下都有，具体位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Policies＼Explorer＼Run，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Policies＼Explorer＼Run。
六、RunServicesOnce注册键
RunServicesOnce注册键用来启动服务程序，启动时间在用户登录之前，而且先于其他通过注册键启动的程序。RunServicesOnce注册键的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServicesOnce，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServicesOnce。
七、RunServices注册键
RunServices注册键指定的程序紧接RunServicesOnce指定的程序之后运行，但两者都在用户登录之前。RunServices的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServices，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunServices。
八、RunOnce＼Setup注册键
RunOnce＼Setup指定了用户登录之后运行的程序，它的位置是：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce＼Setup，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce＼Setup。
九、RunOnce注册键
安装程序通常用RunOnce键自动运行程序，它的位置在HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce和HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnce。HKEY_LOCAL_MACHINE下面的RunOnce键会在用户登录之后立即运行程序，运行时机在其他Run键指定的程序之前。HKEY_CURRENT_USER下面的RunOnce键在操作系统处理其他Run键以及“启动”文件夹的内容之后运行。如果是XP，你还需要检查一下HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼RunOnceEx。
十、Run注册键
Run是自动运行程序最常用的注册键，位置在：HKEY_CURRENT_USER＼Software＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Run，和HKEY_LOCAL_MACHINE＼SOFTWARE＼Microsoft＼Windows＼CurrentVersion＼Run。HKEY_CURRENT_USER下面的Run键紧接HKEY_LOCAL_MACHINE下面的Run键运行，但两者都在处理“启动”文件夹之前。