应用程序（比如PHP）长时间的执行批量的MYSQL语句。执行一个SQL，但SQL语句过大或者语句中含有BLOB或者longblob字段。比如，图片数据的处理。都容易引起MySQLserver has gone away。
今天遇到类似的情景，MySQL只是冷冷的说：MySQL server has gone away。
大概浏览了一下，主要可能是因为以下几种原因：
一种可能是发送的SQL语句太长，以致超过了max_allowed_packet的大小，如果是这种原因，你只要修改my.cnf，加大max_allowed_packet的值即可。
还
有一种可能是因为某些原因导致超时，比如说程序中获取数据库连接时采用了Singleton的做法，虽然多次连接数据库，但其实使用的都是同一个连接，而
且程序中某两次操作数据库的间隔时间超过了wait_timeout（SHOWSTATUS能看到此设置），那么就可能出现问题。最简单的处理方式就是把
wait_timeout改大，当然你也可以在程序里时不时顺手mysql_ping()一下，这样MySQL就知道它不是一个人在战斗。
解决MySQL server has gone away
1、应用程序（比如PHP）长时间的执行批量的MYSQL语句。最常见的就是采集或者新旧数据转化。
解决方案：
在my.cnf文件中添加或者修改以下两个变量：
wait_timeout=2880000
interactive_timeout = 2880000
关于两个变量的具体说明可以google或者看官方手册。如果不能修改my.cnf，则可以在连接数据库的时候设置CLIENT_INTERACTIVE，比如：
sql = "set interactive_timeout=24*3600";
mysql_real_query(...)
2、执行一个SQL，但SQL语句过大或者语句中含有BLOB或者longblob字段。比如，图片数据的处理
解决方案：
在my.cnf文件中添加或者修改以下变量：
max_allowed_packet = 10M(也可以设置自己需要的大小)
max_allowed_packet 参数的作用是，用来控制其通信缓冲区的最大长度。
最
近做网站有一个站要用到WEB网页采集器功能，当一个PHP脚本在请求URL的时候，可能这个被请求的网页非常慢慢，超过了mysql的wait-
timeout时间，然后当网页内容被抓回来后，准备插入到MySQL的时候，发现MySQL的连接超时关闭了，于是就出现了“MySQLserver
has gone away”这样的错误提示，解决这个问题，我的经验有以下两点，或许对大家有用处：
第 一种方法：
当然是增加你的wait-timeout值，这个参数是在my.cnf(在Windows下台下面是my.ini）中设置，我的数据库负荷稍微大一点，所
以，我设置的值为10，（这个值的单位是秒，意思是当一个数据库连接在10秒钟内没有任何操作的话，就会强行关闭，我使用的不是永久链接
（mysql_pconnect),用的是mysql_connect,关于这个wait-timeout的效果你可以在MySQL的进程列表中看到
（show
processlist)），你可以把这个wait-timeout设置成更大，比如300秒，呵呵，一般来讲300秒足够用了，其实你也可以不用设
置，MySQL默认是8个小时。情况由你的服务器和站点来定。
第二种方法：
这也是我个人认为最好的方法，即检查 MySQL的链接状态，使其重新链接。
可
能大家都知道有mysql_ping这么一个函数，在很多资料中都说这个mysql_ping的API会检查数据库是否链接，如果是断开的话会尝试重新连
接，但在我的测试过程中发现事实并不是这样子的，是有条件的，必须要通过mysql_options这个CAPI传递相关参数，让MYSQL有断开自动链
接的选项（MySQL默认为不自动连接），但我测试中发现PHP的MySQL的API中并不带这个函数，你重新编辑MySQL吧，呵呵。但
mysql_ping这个函数还是终于能用得上的，只是要在其中有一个小小的操作技巧：
这是我的的数据库操 作类中间的一个函数
function ping(){
if(!mysql_ping($this->link)){
mysql_close($this->link); //注意：一定要先执行数据库关闭，这是关键
$this->connect();
}
}
我需要调用这个函数的代码可能是这样子的
$str = file_get_contents('http://www.jb51.net');
$db->ping();//经过前面的网页抓取后，或者会导致数据库连接关闭,检查并重新连接
$db->query('select * from table');
ping()这个函数先检测数据连接是否正常，如果被关闭，整个把当前脚本的MYSQL实例关闭，再重新连接。
经 过这样处理后，可以非常有效的解决MySQL server has goneaway这样的问题，而且不会对系统造成额外的开销。
本文摘抄与：http://www.jb51.net/article/23781.htm