在unix、windows外部需要调用R脚本执行，然后又需要输入不同的参数，类似shell脚本的命令行参数输入，可以使用Rcript命令实现。
命令格式：Rscript [options] [-e expression] file [args]
file表示需要执行的脚本，[options] [-e expression] 可以有也可以不用。
file表示需要执行的脚本，[options] [-e expression] 可以有也可以不用。
[args]是参数列表。
首先需要在file文件中的第一行加入：
Args <- commandArgs()
然后按照以下格式执行
Rscript *.R 参数1 参数2 ...
在file脚本中，可以引用参数Args，
Args[1]= "/usr/local/lib64/R/bin/exec/R"
Args[2]= "--slave"
Args[3]= "--no-restore"
Args[4]="--file=a.r"
Args[5]="--args"
Args[2]= "--slave"
Args[3]= "--no-restore"
Args[4]="--file=a.r"
Args[5]="--args"
Args[6]==参数1
Args[7]==参数2
可见输入的参数从第六个和第七个开始。
1 #correctReads.R 2 Args <- commandArgs() 3 print(Args) 4 5 结果输出： 6 $ Rscript correctReads.R 1 2 3 7 [1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/exec/R" 8 [2] "--slave" 9 [3] "--no-restore" 10 [4] "--file=correctReads.R" 11 [5] "--args" 12 [6] "1" 13 [7] "2" 14 [8] "3"
转载于:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/8315948.html