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  • 动态规划串行算法

    写了两天。。感觉确实需要多些代码了。T T

    void give_global_traceback(sequence &seq1,sequence &seq2,sequence &alseq1,sequence &alseq2,int db[][k])
    {
        memset(alseq1.bp, 0, sizeof(char)*k);
        memset(alseq2.bp, 0, sizeof(char)*k);
        int a = 0, b = 0, c = 0;
        //从右下角开始找起,seq2是纵向序列,seq1是横向序列
        int tb_i = seq1.size;   //矩阵中横向的记录
        int tb_j = seq2.size;   //矩阵中纵向的记录
        while(tb_i >= 0 || tb_j >= 0)
        {
            if(tb_i == 0 && tb_j == 0)   //到左上角了,跳出
            {
                break;
            }
            else if(tb_i == 0 && tb_j > 0)   //到左边沿了,往上走
            {
                alseq1.bp[al_i] = 'x';
                tb_j--;
                alseq2.bp[al_j] = seq2.bp[tb_j];
            }
            else if(tb_j == 0 && tb_i > 0)   //到上边沿了,往左走
            {
                alseq1.bp[al_i] = seq1.bp[tb_i];
                tb_i--;
                alseq2.bp[al_j] = 'x';
            }
            else
            {
                a = db[tb_j][tb_i-1];
                b = db[tb_j-1][tb_i];
                c = db[tb_j-1][tb_i-1];
                if (a > b && a > c)        //对纵向序列插空
                {
                    alseq1.bp[al_i] = seq1.bp[tb_i - 1];
                    tb_i--;
                    alseq2.bp[al_j] = 'x';
                }
                else if (b > a && b > c)    //对横向序列插空
                {
                    alseq1.bp[al_i] = 'x';
                    tb_j--;
                    alseq2.bp[al_j] = seq2.bp[tb_j - 1];
                }
                else                        //不插空
                {
                    alseq1.bp[al_i] = seq1.bp[tb_i - 1];
                    alseq2.bp[al_j] = seq2.bp[tb_j - 1];
                    tb_i--;
                    tb_j--;
                }
            }
            al_i++;
            al_j++;
        }
    }

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