VTK序列图像的读取[转][改]

医学图像处理的应用程序中，经常会碰到读取一个序列图像的操作。比如CT、MR等所成的图像都是一个切面一个切面地存储的，医学图像处理程序要处理这些数据，第一步当然是把这些数据从磁盘等外部存储介质中导入内存。

        利用VTK可以读取多种格式的图像文件，支持读取单个的二维图像(比如*.BMP、*.JPEG、*.PNG等)或者三维图像文件(*.VTK、*.mhd、*.mha等)，也支持序列图像文件的导入。下面我们详细地讲解如何在VTK里实现序列图像文件的读取(我们以美国可视人的数据做为测试数据，数据可以从这里下载到)。

在讲解VTK序列图像读取之前，有一个问题需要注意的：就是待读取的序列图像的文件名必须是规则的，比如像下图所示的。

Tips：涉及到指改文件名的，如果熟悉Dos命令的，直接用rename命令就可以完成；或者是使用一个小软件Renamer来修改。

 

图1序列图像的命名示例

方法一：使用SetFileNames()方法读取序列图像。

[cpp] view plaincopy
//生成图像序列的文件名数组  
vtkSmartPointer<vtkStringArray > fileArray =  
vtkSmartPointer<vtkStringArray >::New();  
charfileName[128];  
for(inti = 1; i < 20; i++) //几个图像就循环几次  
{  
sprintf(fileName,"../VisibleWomanHead/VisibleWomanHead_%02d.jpg", i);  
vtkstd::stringfileStr(fileName);  
fileArray->InsertNextValue(fileStr);     
}  
//读取JPG序列图像  
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>reader =  
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>::New();  
reader->SetFileNames(fileArray);  
reader->Update();  

说明：要读取的序列文件是存放在文件夹VisibleWomanHead里的，而且每个图像的命名规则是：VisibleWomanHead_01.jpg，VisibleWomanHead_02.jpg……如图1所示。方法一我们使用了vtkStringArray先构建一个包含要读取的序列图像文件的文件名数组，然后调用vtkJPEGReader里的SetFileNames()方法。方法SetFileNames()是在类vtkImageReader2里实现的，所以大部分VTK图像的读取类都可以用这种方法来读取序列图像文件。

方法二：使用SetFilePrefix()/SetFilePattern()方法读取序列图像。

前面我们已经提过，在读取序列图像文件时，要求序列里的文件名有规律地命名(如图1)，既然这些文件名有规律，我们可以采用vtkImageReader2里的方法SetFilePrefix()/SetFilePattern()来读取序列图像。

vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>reader =
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>::New();
reader->SetFilePrefix ("D:/Data/VisibleWomanHead/VisibleWomanHead_");
reader->SetFilePattern("%s%02d.jpg");
reader ->SetDataExtent (0,511,0,511,1,20);//图像大小是512*512
reader->Update();

至于为什么这么写，你们感受一下就知道了，特别是SetFilePrefix()、SetFilePattern()、SetDataExtent()这几个函数的参数。

方法三：一张一张地读入，然后合并成一个三维的数据体。

vtkSmartPointer<vtkImageAppend > append =
       vtkSmartPointer<vtkImageAppend >::New();
append->SetAppendAxis(2);
 
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>reader =
       vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>::New();
char fileName[128];
for(int i = 1; i < 21; i++)
{
       sprintf(fileName,"D:/Data/VisibleWomanHead/VisibleWomanHead_%02d.jpg", i);
       reader->SetFileName(fileName);
       append->AddInputConnection(reader->GetOutputPort());
}

我们使用类vtkImageAppend做合并的操作，其中方法SetAppendAxis(2)是指定Z轴为读入的每层图像数据的堆叠方向。其他的代码你们继续感受一下，就不再叙述了。

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这里再补充一种用vtkVolume16Reader类,读取DICOM文件的方法：

vtkVolume16Reader *v16 = vtkVolume16Reader::New();
v16->SetFilePrefix( "E:/MedImage Data/Simon/SIMON_" );
v16->SetFilePattern("%s%02d.dcm");
v16->SetDataDimensions (512,512);
v16->SetImageRange (0,54);
v16->SetDataByteOrderToLittleEndian();
v16->SetDataSpacing (0.25, 0.25, 1.0);