一.生物信息学的研究目标
1.特点: 天然的形式化
碱基: ACTG四种
常见的氨基酸:20种
2.目标:
①以DNA序列作为源头
②揭示"基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律"
③之后进行蛋白质结构和功能预测
二.生物信息学的两个挑战
1.高性能计算
①海量的数据
②每14个月翻一番
2.算法
①海量的数据,使得原有算法 不适用
②新需求
三.生物信息学的研究流程
第一步 生物学问题的提出 生物学为主
第二步 数学建模、算法设计 信息学为主
第三步 结果解释、实验验证 生物学
四.生物信息学的脉络
五.生物信息学问题概览
1.基因组时期: 序列-结构-功能
①DNA测序与拼接
②比对
③进化树
④蛋白质质谱鉴定
⑤序列注释:基因预测, 细胞定位
⑥结构预测:RNA结构预测 蛋白质折叠
2.后基因组时期:相互作用-网络-功能
①生物芯片(DNA芯片 蛋白质芯片)
②相互作用网络
③调控网络
④E-Cell
⑤药物设计