RNA Sequencing
国内领先的转录组定序基地
Transcriptome Sequencing可全面性并快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录体(transcriptome)及基因序列，可以用于研究物种基因结构和基因功能、选择性剪接和新的转录序列(transcript)预测等。针对转录体定序研究，与全基因体定序研究一样，可分为两种类型：一种未知参考序列 (No Referenece Genome)的物种转录体定序；另一种则是已具有参考序列的物种转录体定序(例如：人类、水稻)。而相对于传统微阵列晶片(microarray)，转录体定序无须预先针对已之序列设计探针(probe)，即可对任意物种的转录体进行监测，不但可以提供高精确度的量化信号，且具有高通量与高灵敏度等特性，是深入研究转录体的强大工具。
在生物体中，不同的部位、不同发育阶段、或是处于不同环境下所表现的mRNA (messenger RNA)表现均不相同。藉由已知参考序列(基因体参考序列或是转录体参考序列) 的物种之mRNA高通量定序，搭配适当的生物资讯分析流程，便可计算出在不同样品中的各基因表现量。根据客户不同的实验设计，更可以进行样品和样品间的基因差异表现量(differential expression)分析、不同条件下的选择性剪接(alternative splicing)转录分析、以及功能性的分析，包含: Gene Ontology( GO)与生物调控路径(pathway analysis)。
适用研究目的
- 侦测基因表现量。
- mRNA选择性剪切型态。
范例报告
RNA Sequencing。如有任何疑问，欢迎致电/来信指教。
建议策略
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产品
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mRNA Sequencing |
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常见研究目的
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研究物种基因结构和基因功能、选择性剪接和新的转录序列(transcript)预测 |
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建议定序规格
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*定序平台：Proton/Illumina *定序方式：Single-End/Paired-End *定序长度：100-300pb |
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建议定序资料量/定序深度
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5G |
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特殊限制
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需有参考序列(Reference sequence) |
* 如需其他建议策略，欢迎致电/来信询问。
样品需求规格
生资分析流程
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样品类别
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定序项目
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分析层级
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生物资讯分析策略
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RNA
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RNA sequencing
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Basic
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● Quality trim |
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● Mapping to reference genome |
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● Gene expression |
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Advanced
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● Quality trimmed |
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● Mapping to reference genome |
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● Gene expression |
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● Differential expression analysis |
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● GO analysis for genes with significantly different expression level |
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● KEGG metabolic pathways for genes with significantly different expression level |
* 如需客制化生物资讯分析流程，欢迎致电/来信指教。