默认安装路径为：$(prefix) = /usr/local，可以通过./configure --prefix=<new_path>的方法来覆盖。
其它的预定义目录还包括：bindir = $(prefix)/bin, libdir = $(prefix)/lib, datadir = $(prefix)/share, sysconfdir = $(prefix)/etc等等。
configure.ac的编写
最简单的configure.ac必须包含的AC_INIT (package, version, [bug-report], [tarname])、AC_CONFIG_FILES([files])、AC_OUTPUT三个宏，有用到automake的话，则必须添加 AM_INIT_AUTOMAKE和AC_PROG_CC宏。automake一般是要用到的，因为生成的configure会根据 Makefile.in生成Makefile文件，而Makefile.in可以有automake生成。
Makefile.am的编写
1. 需要生成Makefile的目录下都要编写一个Makefile.am
2. 顶层（项目）目录的Makefile.am,可能会包含AUTOMAKE_OPTIONS = foreign 1.4这样一句。
3. 如果当前目录有其它子目录，子目录中也要生成makefile，则要包含
SUBDIRS = 子目录…，例如：SUBDIRS = src doc
4. 对于不需要安装，但是需要一起打包发布的文件，则在当前目录的Makefile.am中可以添加一句：EXTRA_DIST = 发布的文件，例如：EXTRA_DIST = purge.conf purge
5. Makefile.am中的变量名，有统一的命名机制，一般是：安装目录_主变量。
6. 安装目录。
有些标准的安装目录可以直接使用。例：bin_PROGRAMS = hello，表示hello将被安装在$(prefix)/bin目录下。但是这些标准安装目录可能不够使用，因此我们可以自己定义所需要的安装目录。安装目录一般是省略’dir’的，例如：
htmldir = $(prefix)/html
html_DATA = automake.html
就表示automake.html将被安装在$(prefix)/html目录下。这里DATA是主变量，稍后说明。
对于不安装的文件，变量名的目录变量可写为noinst。
7. 主变量。常见的主变量有：`PROGRAMS'、`LIBRARIES'、 `LISP'、`SCRIPTS'、`DATA'、 `HEADERS'、`MANS'和`TEXINFOS'。这些主变量说明了生成的对象类型。例如，主变量PROGRAMS 保存了需要被编译和连接的程序的列表。
8. Makefile.am的例子。
目录结构：
purge-1.2
|―·doc
| |－purge.conf
| |－Makefile.am
|－·src
| |－purge.h
| |－thread.h
| |－…
| |－list.h
| |－debug.c
| |－fun.c
| |－list.c
| |－main.c
| |－map.c
| |－parseconf.c
| |－purge.c
| |－thread.c
| |－Makefile.am
|－hello-0.1.0.spec
|－configure.ac
|－Makefile.am
各目录下的Makefile.am文件可以编写如下：
purge-1.2目录:vi Makefile.am
AUTOMAKE_OPTIONS = foreign 1.4
SUBDIRS = src doc
doc目录:vi Makefile.am
EXTRA_DIST = purge.conf
src目录:vi Makefile.am
bin_PROGRAMS = purge
purge_SOURCES = main.c purge.c fun.c list.c \
parseconf.c thread.c debug.c map.c
purge_LDADD = -lpthread
说明：
a) 在Makefile.am也可以定义变量如：
ALL_SOURCE = main.c purge.c fun.c list.c parseconf.c thread.c debug.c map.c
purge_SOURCES = $( ALL_SOURCE)
b) 名字中除了字母、数字和下划线之外的所有字符都将用下划线代替。例如，如果你的程序被命名为sniff-glue，那么派生出的变量名将是 sniff_glue_SOURCES，而不是sniff-glue_SOURCES；库liblob.a的’_SOURCES’变量对应的变量名 为’liblob_a_SOURCES’，而不是’liblob.a_SOURCES’。
9. 注：共享库必须被安装，所以不允许使用 `noinst_LTLIBRARIES'和`check_LTLIBRARIES'。
10. Makefile.am中configure输出变量的使用。
在configure.ac中通过宏AC_SUBST引出的变量在Makefile.am中就能被使用到。
例子：
在configure.ac中定义如下：
if test -z "$CACHE_ICP_PORT"; then
CACHE_ICP_PORT="3130"
fi
AC_SUBST(CACHE_ICP_PORT)
在Makefile.am中通过@CACHE_ICP_PORT@格式就能引用变量CACHE_ICP_PORT。
例子：DEFAULT_ICP_PORT = @CACHE_ICP_PORT@
Makefile文件
自动生成的Makefile文件常用几个命令如下：
make all - 生成程序、库、文档等，等同于make，根据Makefile编译原始码，连接，生成目标文件，可执行文件。
make install - 安装
make install-strip -安装，去除调试符号
make uninstall - 卸载
make clean - 清除临时文件，make all 的反过程，即清除上次的make命令所产生的object文件（后缀为“.o”的文件）及可执行文件。
make dist - 创建发布包：PACKAGE-VERSION.tar.gz.
在 configure.in 中，有一些被 autoconf 宏预先定义的变量，重要的有如下几个：
bindir：安装可执行文件的目录。
includedir：C 头文件目录。
infodir：info 页安装目录。
mandir：安装手册页的目录。
sbindir：为管理员运行该该程序提供的安装路径。
srcdir：为 Makefile 提供的源代码路径。
top_srcdir：源代码的最上层目录。
LIBS：给连接程序的 -l 选项
LDFLAGS：给连接程序的 stripping（-s）和其他一些选项。
DEFS：给 C 编译器的 -D 选项。
CFLAGS：给 C 编译器的 debug 和优化选项。当调用了 AC_PROG_CC 才有效。
CPPFLAGS：头文件搜索路径（-I)和给 C 预处理器和编译器的其他选项。
CXXFLAGS：给 C++ 编译器的 debug 和优化选项。当调用了 AC_PROG_CXX 才有效。
