电子邮件通常基于明文协议传输，没有加密信息和发件人身份验证服务，攻击者可在邮件传输的任意节点截获数据或篡改内容，造成电子邮件数据泄露或身份仿冒。PGP加密和S/MIME加密都被用于电子邮件加密和验证，但二者在多个方面存在差异。
1.PGP加密
PGP（全称：Pretty Good Privacy，优良保密协议），是一套用于信息加密、验证的应用程序，可用于加密电子邮件内容。PGP本身是商业应用程序；同类开源工具名为GnuPG（GPG）。PGP及其同类产品均遵守OpenPGP数据加解密标准。
PGP是一个基于RSA公匙加密体系的邮件加密软件。
2.S/MIME加密
S/MIME是Secure/Multipurpose Internet Mail Extensions (安全多用途互联网邮件扩展协议)的缩写，是采用PKI技术的用数字证书给邮件主体签名和加密的国际标准协议。1992年，MIME（多用途互联网邮件扩展）协议编撰完成，用于互联网邮件服务器和网关之间通信。该标准方法支持非ASCII编码的附件格式，意味着你可以发送附件并保证文件可以送达另一端，但是附件有时会被篡改，无法确保邮件机密性和完整性。1995年，S/MIME(安全/多用途互联网邮件扩展)协议V1版本开发问世，对安全方面的功能进行了扩展，提供数字签名和邮件加密功能，邮件加密用来保护电子邮件的内容，数字签名用于验证发件人身份，防止身份冒用，并保护电子邮件完整性。1998年和1999年相继出台V2/V3版本并提交IETF形成系列RFC国际标准，加密信息MeSince基于S/MIME标准。
S/MIME是一个新协议，最初版本来源于私有的商业社团RSA 数据安全公司。S/MIME V2版本已经广泛地使用在安全电子邮件上。 但是它并不是IETF 的标准。 因为它需要使用 RSA 的密钥交换，这就受限于美国RSA数据安全公司的专利。
S/MIME同PGP一样，S/MIME也利用单向散列算法和公钥与私钥的加密体系。但它与PGP主要有两点不同：它的认证机制依赖于层次结构的证书认证机构，所有下一级的组织和个人的证书由上一级的组织负责认证，而最上一级的组织（根证书）之间相互认证，整个信任关系基本是树状的，这就是所谓的Tree of Trust。还有，S/MIME将信件内容加密签名后作为特殊的附件传送，它的证书格式采用X.509，但与一般浏览器网上使用的SSL证书有一定差异。
S/MIME使用的密码算法
- 散列算法：SHA-1 MD5
- 非对称密码算法：DSS、DH、RSA
- 对称算法：3DES 、RC2/4
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