举个例子，大家使用那么长时间的Txt和Doc文件格式，也没有去考究他们有什么区别和联系，对于学习ArcGIS中出现的这么多数据格式也不需要过多的考虑，只要对他们的一些基本应用有所了解就可以了：
Shapefile:一种基于文件方式存储GIS数据的文件格式。至少由.shp,.dbf,.shx三个文件作成，分别存储空间，属性和前两者的关系。是GIS中比较通用的一种数据格式。
Coverage:一种拓扑数据结构，一般的GIS原理书中都有它的原理论述。数据结构复杂，属性缺省存储在Info表中。目前ArcGIS中仍然有一些分析操作只能基于这种数据格式进行操作。
Geodatabase:ArcInfo发展到ArcGIS时候推出的一种数据格式，一种基于RDBMS存储的数据格式，其有两大类：1.Personal Geodatabse 用来存储小数据量数据，存储在Access的mdb格式中。
2.ArcSDE Geodatabse 存储大型数据，存储在大型数据库中Oracle,Sql Server,DB2等。可以实现并发操作，不过需要单独的用户许可。
Shapefile是ESRI提出的数据格式，随着ArcView GIS 3.x发布，属于简单要素类。Shapefile由于其数据结构简单，容易实现，得到了广泛的应用，在有段时间，几乎可以说是GIS数据格式的实际格式。当然，随着技术的发展，Shapefile的数据格式显得有些落后了，但它依然是目前应用最为广泛的数据格式。
Shapefile使用点、线、多边形存储要素的形状，具有简单、快速显示的优点；缺点是不能存储拓扑关系。一个shapefile是由若干个文件组成的，空间信息和属性信息分离存储，所以称之为“基于文件”的GIS数据格式。
每个shapefile，都至少有这三个文件组成，其中：
- *.shp文件，存储的是几何要素的的空间信息，也就是XY坐标；
- *.shx文件，存储的是有关*.shp存储的索引信息。它记录了在*.shp中，空间数据是如何存储的，XY坐标的输入点在哪里，有多少XY坐标对等信息；
- *.dbf文件，存储地理数据的属性信息的dBase表。
这三个文件是构成一个shapefile的基本文件，shapefile还可以有其他一些文件，但所有这些文件都与该shapefile同名，并且存储在同一路径下。
其它较为常见的文件：
- *.prj文件，如果shapefile定义了坐标系统，那么它的空间参考信息将会存储在*.prj文件中；
- *.shp.xml文件，这是对shapefile进行元数据浏览后生成的xml元数据文件；
- *.sbn文件和*.sbx文件，这两个存储的是shapefile的空间索引，它能加速空间数据的读取。这两个文件是在对数据进行操作、浏览或连接后才产生的，也可以在ArcGIS中通过ArcToolbox >Data Management Tools >Indexes >Add spatial Index工具生成。
当使用ArcCatalog对shapefile进行创建、移动、删除或重命名等操作，或使用ArcMap对shapefile进行编辑时，ArcCatalog将自动维护数据的完整性，将Shapefile视为一个数据集。
虽然Shapefile无法存储拓扑关系，但它并不仅仅是普通用于显示的图形文件，作为地理数据，它自身是有拓扑的。比如一个多边形要素类，shapefile会按顺时针方向为它的所有顶点排序，然后按顶点顺序两两连接成的边线向量，在向量右侧的为多边形的内部，在向量左侧的是多边形的外部。
由于1990年代地理信息的迅速发展以及ArcView GIS 3.x软件在世界范围内的推广，shapefile格式的数据使用非常广泛，数据来源也较多。很多软件都提供了向shapefile转换的接口（如：MapInfo、MapGIS等）。ArcGIS支持对shapefile的编辑操作，也支持shapefile向第三代数据模型geodatabase的转换。
引用：http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ea1c9c90101lv3b.html