Shuffle基本流程
spark shuffle从总体来讲分成两部分，shuffle write和shuffle reader，如下图所示，看到这里，就明白了为什么spark性能优化的时候建议宁可broadcast也不要shuffle，broadcast好歹还是内存操作，网络上大一点压力（每个节点都要病毒式传播），shuffle可是真金白银的写入hdfs，hdfs可以还要复制和备份的哦。
spark shuffle的理解要从他的语境理解，即放在spark的全流程，下图简单的描述了spark的基本过程：mapper通过算子执行，访问数据源（可以是DB，hdfs，Hbase...)获取数据，之后通过shuffle writer写入到HDFS完，Shuffle Write其实做的最重要的一点是分区。
完成之后，stage2 reducer将会通过shuffle reader来获取数据（通信技术有Socket和Netty两种），Reader将会访问Driver的MapOutputTrackerMaster获取数据存放的位置（Block地址），获取到了数据，获取机制是每次拉取一定大小数据（默认是32K），拉取过来的数据放在指定区域，spark的内存区域是有一部分专门用于获取shuffle数据的Cache（在Spark内存模型中，定义了一块Execution区域，默认是JVM内存的20%），这里注意Reducer的处理并不是数据全部取完之后才进行处理，而是便Fetch，边处理;当数据量大于Cache大小将会保存到本地硬盘。
Stage和Shuffle
简单讲，Stage的划分就是为了Shuffle，Stage是因为Shuffle的存在而存在的，因为分布式的数据操作必然有数据的传输。但是这种传输有两种，一种是最后阶段的传输，通常我们将的action操作；但是很多的shuffle是发生在transformation操作。
Spark Shuffle历史
理解spark的shuffle细节，参看了一些资料，从历史的演化来理解还是比较好，一种成长感。
Hash Shuffle V1
spark第一代shuffle，write和reader部分架构确立，但是writer写文件的模式是每个task都会生成和reducer数量相同的文件，这意味着生成的文件总数为Num(total_task) * Num（total_reducer)，如果500个task，10个reducer，那么生成的文件总数为500 * 10，生成文件量很大。
在shuffle writer之前，存储在内存里面的数据结构是按照Bucket来划分的，Bucket对应的未来的Reducer，是对于分区的（每个区对应一个Reducer）抽象，像一个篮子，每个Task都有自己的篮子，获取到了数据，取出key进行Hash，然后基于Hash值和Reducer的数量，把数据都放在对应的篮子中；Bucket里面的数据待数据处理完成后是要刷到HDFS的一个文件中进行存储。
之所以称之为Hash Shuffle，是因为生成文件的时候是按照Hash来对数据进行分区，然后根据Reducer的数量来组织文件数据，Hash成为了Shuffle主要处理的内容。
因为文件量/数据量很大，在Reducer端读取数据数据的时候，采用的HashMap数据结构，经常会因为文件量过大而导致了OOM。
Hash Shuffle V2
到了一代shuffle，主要是文件写入的模式发生了变化，之前是每个task都写入一个新的文件，这一代进化为同一个executor下面，各个task写入同一个文件，Num(Executor) * Num(total_reducer)，基于此，spark提出了consolidation这个概念（通过设置spark.shuffle.consolidation=true，此配置默认为false），比如还是500个task，分散到10个Executor（每个Executor50个task），文件总数就是10 * 10个，文件量比V1时代小了很多了。
因为Reducer端读取仍然采用HashMap数据结构，还是会经常会OOM（文件虽然少了，但是数据量还是那么大）；所以说Hash Shuffle V2优化的是Writer端
Sort Shuffle V1
后来spark借鉴了MapReduce的Shuffle，就是在对数据进行shuffle的时候，将数据进行排序，这个优势主要是在于减轻了Reducer的压力，否则Reducer进行的全局重排，如果在map阶段借助各个Map节点的算力现在本地进行排序，然后再在reducer进行全局排序的时候就轻松很多了。比如我们将ReduceByKey要比GroupByKey要快，就是因为前者在Map端将会通过SortBaseShuffleWrite对数据进行排序（后面将会介绍除了SortBase还有BypassMerger方式，不会对数据进行排序）
从sort shuffle开始，开始有了spill即落盘，上面描述的数据的排序其实发生在spill的时刻；这里有了"file segment"的概念，落盘文件结构是两层次，首先是按照分区进行排列出来一块一块的FileSegment，在FileSegment内部是按照key进行排序；生成数据文件之外还有维护一个Index文件，这个index文件用于指向各个分区在文件中的偏移量，这样在reducer阶段读取分区数据的时候根据这个index文件即可；
Spill的发生是根据内存中spark的数据量，达到了阈值之后，将会把内存中的数据flush到硬盘中，map阶段数据完成后，将会进行shuffle write，会将各个flush的文件进行整合成一个文件然后存到HDFS中，是的，到了Sort Shuffle每个Exexutor只有一个文件，这样输出的文件总量为Num(Executor) ，比值Hash Shuffle v2有少了一些。
除此之外，在Reducer端也进行了优化，读取数据的结构改为了ExternalAppendOnlyMap，该数据结构首先把数据存在内存中，如果内存不够了会将数据flush到硬盘中，这样就避免了OOM情况，到了Sort Shuffle时代，OOM的问题终于解决了。
Tungsten Sort Base Shuffle
Tungsten期初是spark一个尝试的功能，他使用的堆外内存空间，因为采用的jvm来访问堆外内存，所以又称之为unsafe sort；将数据进行序列化之后（KyroSerial），，所以之后使用序列化之后数据（二进制）进行排序，这里不是使用Java对象，所以JVM的GC压力比较小；使用JVM之外的内存进行排序，这样效率比较高，而且因为序列化以及排序都是在堆外，所以GC压力小了很多，减少了大量的垃圾回收的次数。
这是因为Tungsten的序列化-排序机制，该方式并不适合聚合的算子（无法进行稍微复杂的数据操作），只适合类似于join这类算子，而且分区数一定要小于2^24 -1（这个分区数估计也没谁了，基本都会小于）。
Sort Shuffle V2
到了这一代，Tungsten Sort正是转正，Spark将会自动根据算子来决定是采用Sort Shuffle还是采用Tungsten Sort；同时Hash Shuffle也退出了历史舞台。
虽然HashShuffle退出了历史舞台，但是HashShuffle的模式并没有消失，因为HashShuffle还是有其优势：不需要排序，所以处理的速度还是要比Sort要快；所以Spark提供了ByPassMergeSortShuffleWriter来进行类似于Hash Shuffle的机制，该处理应用在一些不需要排序的场景，比如repartition操作；
BypassShuffle机制和HashSortBaseShuffle基本一致，只是写文件遵循只向一个文件里面写，可以说是把性能推向机制；但是ByPass的shuffle只是适用于Num（Reducer）比较小的场景，因为ByPass在shuffle的全过程是要把所有的文件都打开，如果Reducer太多，对增加本地IO压力，ByPassShuffle的文件数量阈值（Reducer数量阈值）是在spark.shuffle.bypassmergeThreshold属性配置，默认是200。
到了spark2.x时代只有三种Shuffle：排序类，SortBaseShuffleWriter，非排序类，ByPassMergeSortShuffleWriter以及TungstenSortBaseShuffleWriter；非排序优先使用Tungsten类Shuffle。干预shuffle种类的选择，请看下图：
spark的shuffle技术历史节点
- Spark 0.8 及以前 Hash Based Shuffle
- Spark 0.8.1 为 Hash Based Shuffle引入File Consolidation机制
- Spark 0.9 引入 ExternalAppendOnlyMap
- Spark 1.1 引入 Sort Based Shuffle，但默认仍为 Hash Based Shuffle
- Spark 1.2 默认的 Shuffle 方式改为 Sort Based Shuffle
- Spark 1.4 引入 Tungsten-Sort Based Shuffle
- Spark 1.6 Tungsten-Sort Based Shuffle 并入 Sort Based Shuffle
- Spark 2.0 Hash Based Shuffle 退出历史舞台
附录
什么是spark的分区
分区的本质就是将数据，按照key进行汇总，聚类为几部分，便于后面算子的处理；为什么要有分区？其实是为了数据平衡，下一个stage算子也是要分布在几个节点，为了使得每个节点都能够处理差不多数量的数据，所以对数据进行分区。
关于宽依赖和窄依赖的shuffle
跨依赖是指子RDD要依赖于2个以上父RDD分区，因为依赖多个分区，所以就需要进行任务协调，在RDD一定是要等到以来的父RDD的分区都完成了才会尽心数据的fetch（shuffle read）；这种协调（同步）通过各个分区完成后shuffle到datablock的方式解决，父RDD的数据写入到中间存储，子RDD得知父RDD完成后，根据MapOutputTrackerMaster里面记录的信息获取即可。
所以shuffle的本质并不是跨节点/跨进程，本质其实是任务协调的一种实现。
关于HBase
HBase和spark所负责的阶段式不一样的，HBase存储主要是map的查询（获取数据）阶段，如果想要在这个阶段性能调优，需要考虑到HBase的设计，优化，比如rowey设计，文件split，merge等等，这些操作其实目的都是让search阶段（map阶段）高效，迅速以及自身文件存储性能（比如memstore）；Spark的shuffle则是负责数据已经获取之后，如何操作更加快捷。所以他们所起到的作用是不同的阶段。
Hadoop MapReduce
Spark的Shuffle是在Hadoop的MapReduce之后，很多机制都是参考了MapReduce的机制，比如Sort Base Shuffle，这里简单介绍一下MR的Shuffle以及他和Spark Shuffle的异同点。
从上图可以看到，MR的全流程，首先Input即算子下发各个worker节点（这个相当于Spark的Executor），然后是Map的stage（这个和Spark的Stage基本一致），这里划分为两个阶段：
spill过程：获取数据，在获取数据的过程中首先将数据放置到缓存中（默认48M），缓存满了后就会将文件flush到本地存成文件，注意在spill前将会对数据进行一次排序，排序完成后再写入到磁盘中；
merge过程：map task把数据处理完成后，会将spill的数据文件进行合并；在文件合并的过程，将会进行全局的排序；并基于Hash算法以及Reducer数量，进行分区操作；然后Spill写入到本地文件，数据全部处理完成后，将会进行文件Merge（和Sort Shuffle的机制基本一致），然后写入到HDFS中；
在reducer端同样经历两个过程：
copying阶段：通过访问TaskTracker获知map阶段存储的文件路径，然后通过Http协议进行数据拉取。（这里有区别，spark采用的socket和netty框架，效率比MapReduce要高）拉取的过程中，和spill阶段一样，会将充满的缓冲区数据flush到硬盘中；
merge阶段：reducer的数据处理完成后，将会对于数据进行合并以及全局reducer算子处理，完成后，shuffle到合并节点
spark和mapreduce处理有如下区别：
Spark的DAG模式提供了高层数据操作处理，可以实现比MR更加复杂操作，比如coGroup，可以合并多个不同源的Map数据。而mapreduce的机制只能处理同一个来源的数据；
从shuffle处理多样性而言，spark更加丰富，spark提供了三种shuffle类型，分别针对不同的场景择优选择，而MR的shuffle则只有一种sort Shuffle
reducer中微妙的差别，Hadoop是等到buffer快满的时候，才进行combin()操作，而spark则是边拉取数据边进行数据立即和内存中已经有的数据reduce算子操作；
参考：
https://www.cnblogs.com/jcchoiling/p/6431969.html
spark shuffle
https://zhuanlan.zhihu.com/p/67061627 历史进程结构来描述spark shuffle，参考此篇博文
https://www.jianshu.com/p/286173f03a0b 此文甚好，图文并茂，我的很多截图就是来自此文
https://www.cnblogs.com/jcchoiling/p/6431969.html stage和shuffle的关系，有此文引起；另外此文有很多spark shuffle的源码的解读，有时间还是应该好好看看
https://www.zhihu.com/question/27643595 mapreduce的shuffle和shpark区别
https://blog.csdn.net/shuimofengyang/article/details/81534069 mapreduce的流程描述参考此文