退出整个应用解决方案

1、配合FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP使用，但是service不能被杀掉

private void showTips() {

        AlertDialog alertDialog = new AlertDialog.Builder(this).setTitle("提醒").setMessage("是否退出程序")
                .setPositiveButton("确定", new DialogInterface.OnClickListener() {

                    public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
                        //startActivity先清楚之前所有的activity再跳转到主界面
                        Intent intent = new Intent(Intent.ACTION_MAIN);
                        intent.addCategory(Intent.CATEGORY_HOME);
                        intent.setFlags(Intent.FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP);
                        startActivity(intent);
                        //杀死当前进程，只能消灭当前Activity
                        android.os.Process.killProcess(android.os.Process.myPid());
                    }

                }).setNegativeButton("取消",

                        new DialogInterface.OnClickListener() {
                            public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
                                return;
                            }
                        })
                .create(); // 创建对话框
        alertDialog.show(); // 显示对话框
    }

Done