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  • TFRecord数据处理

    一、TFRecord数据格式

    对于深度学习的物体检测等任务,比较常用的数据集是PASCAL VOC数据集。对于PASCAL VOC数据集,主要有两个文件夹,分别为:Annotations和JPEGImages。其中,Annotations文件夹存储了图片物体的label,格式为XML格式,而JPEGImages文件夹下存放的是图片。这种数据集需要将图像数据和标签分开放置,比较不友好。

    对于使用tensorflow框架进行训练深度神经网络时,tensorflow提供了对图像数据进行处理的工具——TFRecord。其将数据标签和图像数据存储在一起,方便管理。

    TFRecord通过tf.train.Example Protocol Buffer协议进行数据存储的。tf.train.Example的定义如下:

    message Example {
        Features features = 1;
    };
    
    message Features {
        map<string, Feature> feature = 1;
    };
    
    message Feature {
        oneof kind {
            BytesList bytes_list = 1;
            FloatList float_list =2;
            Int64List int64_list = 3;
        }
    };

    tf.train.Example包含了一个从属性到取值的字典。属性的取值可以为字符串、实数列表和整数列表。

    二、图像预处理

    对于图像预处理,tensorflow提供了几种方法,主要包括:

    1、调整图像大小

    tf.image.resize_images

    例如:resized = tf.image.resize_images(img_data, [300, 300], method=0)

    tf.image.resize_images函数的method参数对应不同的图像调整算法,如下图所示;

    method取值 图像大小调整算法
    0 双线性插值法
    1 最近邻居法
    2 双三次插值法
    3 面积插值法

    不同算法调整图像大小的结果差不多。除了将整张图像信息完整保存,tensorflow还支持对图像进行裁剪或者填充(tf.image.crop_to_bounding_box函数、tf.image.pad_to_bounding_box和tf.image.resize_image_with_crop_or_pad函数)。

    2、图像色彩调整

    tf.image.adjust_brightness、tf.image.adjust_contrast、tf.image.adjust_hue、tf.image.adjust_saturation

    3、处理标注框

    tf.image.draw_bounding_box

    4、随机截取图像

    tf.image.sample_distorted_bounding_box

    三、多线程输入数据处理框架

    对于第二节中tensorflow提供的数据预处理方法,虽然可以减小无关因素对图像识别模型的效果的影响,但是这些预处理方式比较复杂,会减慢整个训练的过程。因此,为了避免图像预处理称为神经网络模型训练效率的瓶颈,tensorflow提供了一套多线程处理输入数据的框架。其主要的流程图如下:

    3.1队列和多线程

    在tensorflow中,队列和变量类似,都是计算图上有状态的节点。其他的计算节点可以修改他们的状态。对于变量,可以通过赋值操作修改变量的值,而对于队列而言,修改队列的状态的操作有:Enqueue、EnqueueMany和Dequeue。

     tensorflow提供了tf.Coordinator和tf.QueueRunner两个类完成多线程协同的功能。tf.Coordinator主要用于协同多个线程一起停止,并提供了should_stop、request_stop和join三个函数。在启动线程之前需要先声明一个tf.Coordinator类,并将这个类传入每一个创建的线程中。启动的线程需要一直查询tf.Coordinator类中提供的should_stop函数,当这个函数的返回值是True时,则当前的线程需要退出。当某一个线程调用request_stop函数之后,should_stop函数的返回值将被设置为True,这样所有的线程就可以同时终止了。

    实例:

    import tensorflow as tf
    import numpy as np
    import threading
    
    # 线程中运行的程序,这个程序每隔1秒判断是否需要停止并打印自己的ID
    def MyLoop(coord, worker_id):
        # 使用tf.Coordinator类提供的协同工具判断当前进程是否需要停止
        while not coord.should_stop():
            # 随机停止所有线程
            if np.random.rand() < 0.1:
                print("Stoping from id: %d
    " % worker_id)
                coord.request_stop()
            else:
                print("working on id: %d
    " %worker_id)
    
    # 声明一个tf.train.Coordinator类来协同多个线程
    coord = tf.train.Coordinator()
    # 创建5个线程
    threads = [threading.Thread(target=MyLoop, args=(coord, i)) for i in range(5)]
    
    # 启动所有线程
    for t in threads:
        t.start()
    
    # 等待所有线程退出
    coord.join()

    3.2输入文件队列

    本节介绍使用tensorflow中的队列管理输入文件列表。

    为了提高处理效率,当训练的数据量较大时,通常将数据分成多个TFRecord文件保存。tensorflow提供了获取符合正则表达式获取文件的函数:tf.train.match_filenames_once。对于得到的文件列表,可以通过tf.train.string_input_producer函数进行管理。

    tf.train.string_input_producer函数会使用初始化时提供的文件列表创建一个输入队列,输入队列中原始元素为文件列中的所有文件。

    实例:

    1、将数据转换成TFRecord格式,写入文件

    import tensorflow as tf
    
    # 创建TFRecord文件的帮助函数
    def _int64_feature(value):
        return tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))
    
    # 写入数据
    num_shards = 2
    instances_per_shard = 2
    
    # 写入数据,文件后缀为:000n-of-000m,m为训练数据总的被存放在了多少个文件,n为当前的文件编号
    # 这种命名方式,方便了使用正则表达式获取文件列表
    for i in range(num_shards):
        filename = ('/path/to/data.tfrecords-%.5d-of-%.5d' % (i, num_shards))
    
        writer = tf.python_io.TFRecordWriter(filename)
        
        # 将数据封装成Example结构并写入TFRecord文件
        for j in range(instances_per_shard):
            example = tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature={
                'i': _int64_feature(i),
                'j': _int64_feature(j)}))
    
            writer.write(example.SerializeToString())
        writer.close()

    2、读取TFRecord数据实例

    import tensorflow as tf
    
    # 使用tf.train.match_filenames_once函数获取文件列表
    files = tf.train.match_filenames_once("/path/to/data.tfrecords-*")
    
    # 通过tf.train.string_input_producer函数创建输入队列,输入队列的文件列表为tf.train.match_filenames_once函数获取文件列表
    filename_queue = tf.train.string_input_producer(files, shuffle=True)
    
    # 解析一个样本
    reader = tf.TFRecordReader()
    _, serialized_example = reader.read(filename_queue)
    features = tf.parse_single_example(serialized_example,
                                       features={
                                           'i': tf.FixedLenFeature((), tf.int64),
                                           'j': tf.FixedLenFeature((), tf.int64)
                                       })
    
    with tf.Session() as sess:
        tf.local_variables_initializer().run()
        print(sess.run(files))
        
        # 声明tf.train.Coordinator类来协同不同的现场,并且启动线程
        coord = tf.train.Coordinator()
        threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess, coord=coord)
        
        for i in range(6):
            print(sess.run([features['i'], features['j']]))
        coord.request_stop()
        coord.join(threads)

    3.3组合训练数据

    通常在训练神经网络时,我们一次输入一个batch的数据量,这样可以提高训练效率。所以得到单个样例的预处理结果之后,还需要将它们组织成batch,然后输入网络的输入层。tensorflow提供了这样的函数:tf.train.batch以及tf.train.shuffle_batch。

    实例:

    import tensorflow as tf
    
    files = tf.train.match_filenames_once("/path/to/data.tfrecords-*")
    
    file_queue = tf.train.string_input_producer(files)
    
    # 解析一个样本
    reader = tf.TFRecordReader()
    _, serialized_example = reader.read(filename_queue)
    features = tf.parse_single_example(serialized_example,
                                       features={
                                           'i': tf.FixedLenFeature((), tf.int64),
                                           'j': tf.FixedLenFeature((), tf.int64)
                                       })
    
    example, label = features['i'], features['j']
    
    batch_size = 3
    
    capacity = 1000 + 3 *batch_size
    
    example_batch, label_batch = tf.train.batch([example, label], batch_size=batch_size capacity=capacity)
    
    
    with tf.Session() as sess:
        tf.global_variables_initializer().run()
        coord = tf.train.Coordinator()
        threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess, coord=coord)
        
        for i in range(2):
            cur_example_batch, cur_label_batch = sess.run(
                [example_batch, label_batch])
            
            print(cur_example_batch, cur_label_batch)
        
        coord.request_stop()
        coord.join(threads)

    其中,调用tf.train.start_queue_runners, 启动入队线程,由多个或单个线程,按照设定规则,把文件读入Filename Queue中。函数返回线程ID的列表,一般情况下,系统有多少个核,就会启动多少个入队线程(入队具体使用多少个线程在tf.train.batch中定义);

    (参考:https://blog.csdn.net/dcrmg/article/details/79780331

    3.4高层处理框架slim

    除了使用tf.train提供的方法进行获取批量的训练TFRecord数据,对于tensorflow的高层封装tf.slim处理。

    通过slim读取TFRecord数据,主要分为以下几个步骤:

    1、定义解码器decoder

    decoder = tf.slim.tfexample_decoder.TFExampleDecoder()

    其中,定义解码器时,需要制定两个参数:keys_to_features,和items_to_handlers两个字典参数。key_to_features这个字典需要和TFrecord文件中定义的字典项匹配。items_to_handlers中的关键字可以是任意值,但是它的handler的初始化参数必须要来自于keys_to_features中的关键字。

    2、定义dataset

    dataset= tf.slim.dataset.Dataset()

    其中,定义dataset时需要将datasetsource、reader、decoder、num_samples等参数

    3、定义provider

    provider = slim.dataset_data_provider.DatasetDataProvider

    其中,需要的参数为:dataset, num_readers, reader_kwargs, shuffle, num_epochs,common_queue_capacity,common_queue_min, record_key=',seed, scope等。

    4、调用provider的get方法

    获取items_to_handlers中定义的关键字

    5、利用分好的batch建立一个prefetch_queue

    6、prefetch_queue中有一个dequeue的op,每执行一次dequeue则返回一个batch的数据。

    (参考:

    https://www.jianshu.com/p/63eb53cb5b73

    https://blog.csdn.net/MOU_IT/article/details/82773839

    实例:

    # 构造第一个参数:数据目录+文件名
    file_pattern = os.path.join(dataset_dir, self.param.FILE_PATTERN % train_or_test)

    # 准备第二个参数:
    reader = tf.TFRecordReader

    # 准备第三个参数:decoder
    # 反序列化的格式
    keys_to_features = {
    'image/encoded': tf.FixedLenFeature((), tf.string, default_value=''),
    'image/format': tf.FixedLenFeature((), tf.string, default_value='jpeg'),
    'image/height': tf.FixedLenFeature([1], tf.int64),
    'image/width': tf.FixedLenFeature([1], tf.int64),
    'image/channels': tf.FixedLenFeature([1], tf.int64),
    'image/shape': tf.FixedLenFeature([3], tf.int64),
    'image/object/bbox/xmin': tf.VarLenFeature(dtype=tf.float32),
    'image/object/bbox/ymin': tf.VarLenFeature(dtype=tf.float32),
    'image/object/bbox/xmax': tf.VarLenFeature(dtype=tf.float32),
    'image/object/bbox/ymax': tf.VarLenFeature(dtype=tf.float32),
    'image/object/bbox/label': tf.VarLenFeature(dtype=tf.int64),
    'image/object/bbox/difficult': tf.VarLenFeature(dtype=tf.int64),
    'image/object/bbox/truncated': tf.VarLenFeature(dtype=tf.int64),
    }
    # 2、反序列化成高级的格式
    # 其中bbox框ymin [23] xmin [46],ymax [234] xmax[12]--->[23,46,234,13]
    items_to_handlers = {
    'image': slim.tfexample_decoder.Image('image/encoded', 'image/format'),
    'shape': slim.tfexample_decoder.Tensor('image/shape'),
    'object/bbox': slim.tfexample_decoder.BoundingBox(
    ['ymin', 'xmin', 'ymax', 'xmax'], 'image/object/bbox/'),
    'object/label': slim.tfexample_decoder.Tensor('image/object/bbox/label'),
    'object/difficult': slim.tfexample_decoder.Tensor('image/object/bbox/difficult'),
    'object/truncated': slim.tfexample_decoder.Tensor('image/object/bbox/truncated'),
    }

    # 构造decoder
    decoder = slim.tfexample_decoder.TFExampleDecoder(keys_to_features, items_to_handlers)

    dataset = slim.dataset.Dataset(
    data_sources=file_pattern,
    reader=reader,
    decoder=decoder,
    num_samples=self.param.SPLITS_TO_SIZES[train_or_test],
    items_to_descriptions=self.param.ITEMS_TO_DESCRIPTIONS,
    num_classes=self.param.NUM_CLASSES)

    provider = slim.dataset_data_provider.DatasetDataProvider(
    dataset,
    num_readers=4,
    common_queue_capacity=20 * FLAGS.batch_size,
    common_queue_min=10 * FLAGS.batch_size,
    shuffle=True
    )

    # 通过get获取数据,获取到的数据是单个数据,还需要对数据进行预处理,组合数据
    # 真正获取参数
    [image, shape, glabels, gbboxes] = provider.get(['image', 'shape', 'object/label', 'object/bbox'])

    # 直接进行数据预处理
    # image [?, ?, 3]---->[300, 300, 3]
    image, glabels, gbboxes = image_preprocessing_fn(image, glabels, gbboxes,
                                                     out_shape=ssd_shape,
                                                     data_format=DATA_FORMAT)

    # 特征值、目标
    # 批处理以及队列处理
    # tensor_list:tensor列表 [tensor, tensor, ]
    # tf.train.batch(tensor_list, batch_size, num_threads, capacity)

    # [Tensor, [6], [6], [6]] 嵌套的列表要转换成单列表形式
    r = tf.train.batch(train_tools.reshape_list([image, gclasses, glocalisations, gscores]),
                       batch_size=FLAGS.batch_size,
                       num_threads=4,
                       capacity=5 * FLAGS.batch_size)

    # 批处理数据放入队列
    # 1个r:批处理的样本, 5个设备,5个r, 5组32张图片
    # 队列的目的是为了不同设备需求
    #最后组装好的数据出队列dequeue
    batch_queue = slim.prefetch_queue.prefetch_queue(r, capacity=deploy_config.num_clones)

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