interpro 通过整合多个蛋白相关的数据库,提供了一个方便的对蛋白序列进行功能注释的平台,功能注释的内容包括蛋白质家族预测,domain 和 结合位点预测
interoro 在整合多个数据库的同时,去掉了冗余,提供了一个统一的接口,用来对序列进行功能注释;而且还提供了interproscan 这样的命令行工具,可以方便的对
大规模的蛋白序列进行注释,目前, UniprotKB 和 Gene Ontology 就是使用 interproscan 对蛋白序列进行注释的。
interpro 数据库每两个月更新一次
interpro 的成员数据库包括:
CATH-Gene3D
CDD
MobiDB:
HAMAP:
PANTHER:
PIRSF:
PRINTS:
ProDom:
PROSITE:
SFLD:
SMART:
SUPERFAMILY:
TIGRFAMS:
Pfam
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