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  • interpro 数据库

    interpro 通过整合多个蛋白相关的数据库,提供了一个方便的对蛋白序列进行功能注释的平台,功能注释的内容包括蛋白质家族预测,domain 和 结合位点预测

    interoro 在整合多个数据库的同时,去掉了冗余,提供了一个统一的接口,用来对序列进行功能注释;而且还提供了interproscan 这样的命令行工具,可以方便的对

    大规模的蛋白序列进行注释,目前, UniprotKB 和 Gene Ontology 就是使用 interproscan 对蛋白序列进行注释的。

    interpro 数据库每两个月更新一次

    interpro 的成员数据库包括:

    CATH-Gene3D

    CDD

    MobiDB:

    HAMAP:

    PANTHER:

    PIRSF:

    PRINTS:

    ProDom:

    PROSITE:

    SFLD:

    SMART:

    SUPERFAMILY:

    TIGRFAMS:

    Pfam

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/7063689.html
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