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    Linux安装HDF5及遇到的问题总结

    转自: http://www.linuxdiyf.com/linux/26164.html
     
    ubuntu版本:16.04.2 64位
    从HDF官网(https://support.hdfgroup.org/HDF5/)上下载hdf5-1.8.17.tar.gz
    Linux安装HDF5及遇到的问题总结
     
    简要安装步骤如下:(详细步骤:hdf5-1.8.17/release_docs/INSTALL)
    $ gunzip < hdf5-X.Y.Z.tar.gz | tar xf -   #解压缩
    $ cd hdf5-X.Y.Z
    $ ./configure --prefix=/usr/local/hdf5  #安装路径
    $ make
    $ make check                # run test suite.
    $ make install
    $ make check-install        # verify installation.
    注:X.Y.Z是HDF版本
     
    安装成功后,在安装目录/usr/local下出现hdf5文件夹,打开后
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    在/share/hdf5_examples/下是示例程序。打开c文件夹,下面我们来测试。该文件夹下有个名为run-c-ex.sh文件,执行该文件可以将c目录下所有.c文件执行。
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    运行命令:$ sudo ./run-c-ex.sh
    即可得到所有文件的执行结果。
     
    打开run-c-ex.sh文件可查看该文件内容如下
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    下面我们来讲怎么执行单个.c文件,以/usr/local/hdf5/share/hdf5_examples/c目录下h5_extend.c为例
    执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c
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    可是却报出错误:h5cc:command not found
    我们在命令行输入h5cc,可以看到
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    提示我们h5cc没有安装,按照指示,我们输入sudo apt install hdf5-helpers
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    接下来再执行,却报出hdf5.h: No such file or directory的错误
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    只要安装libhdf5-serial-dev就可以了。
    执行命令:$ sudo apt-get install libhdf5-serial-dev
    Linux安装HDF5及遇到的问题总结
    再次执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c
    没有问题,执行:$ ./h5_extend
    Linux安装HDF5及遇到的问题总结
    在/share/hdf5_examples/c目录下除了生成h5_extend和h5_extend.o两个文件,还有extend.h5文件。
    Linux安装HDF5及遇到的问题总结
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    下面介绍一个可视化工具HDFView,它可以用来查看和编辑HDF文件。(https://support.hdfgroup.org/products/Java/hdfview/)
    下载HDFView,即可查看我们刚刚得到的extend.h5
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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/xuyuan77/p/7777407.html
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