Ensemble公共MySQL数据库
对于大量数据和更详细的分析，Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org，useastdb.ensembl.org或asiadb.ensembl.org，可以以匿名方式访问。 第三台服务器martdb.ensembl.org提供对BioMart数据库的公共访问。 如果您对人体GRCh37装配的数据感兴趣，只能在ensembldb.ensembl.org上获得（参见下面的连接细节）。
从Ensembl数据库中检索数据有两种选择：
Perl API
Perl API（详细）
MySQL客户端
使用MySQL客户端登录Ensembl数据库需要了解使用的复杂数据库模式的知识。另外还要注意，数据库MySQL查询不支持检索序列; 要检索序列，请使用Perl API。
| Server | User | Password | Port(s) | Version | Notes |
|---|---|---|---|---|---|
| ensembldb.ensembl.org | anonymous | - | 3306 & 5306 | MySQL 5.6.33 | From Ensembl 48 onwards only |
| useastdb.ensembl.org | anonymous | - | 3306 & 5306 | MariaDB 10.0.30 | Current and previous Ensembl version only |
| asiadb.ensembl.org | anonymous | - | 3306 & 5306 | MariaDB 10.0.30 | Current and previous Ensembl version only |
| martdb.ensembl.org | anonymous | - | 5316 | MariaDB 10.0.30 | From Ensembl 48 onwards only |
| ensembldb.ensembl.org | anonymous | - | 3337 | MySQl 5.6.33 | Databases for archive GRCh37 - release 79 onwards |
| ensembldb.ensembl.org | anonymous | - | 4306 | MySQL 4.1.20 | Up to Ensembl 47 only |
| martdb.ensembl.org | anonymous | - | 3316 | MySQL 4.1.20 | Up to Ensembl 47 only |
Ensembl API
Ensembl API支持多种语言GET或POST请求访问，返回json或xml格式的信息。