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  • 做成像的你不得不了解的真相8-如影随形的噪声(下)

           前两篇如影随形的噪声(上,中) 我们讨论了图像的主要噪声源。了解噪声的目的,是为了尽可能提升图像的信噪比。本期小编就想和大家探讨一下,常用的提升信噪比方法的技术原理,并对他们的效果做定量分析。

           以下的讨论,都是基于这个基本信噪比公式: 

     

    另外,对生物成像应用,我们有以下假设:

    1. 制冷相机的暗电流可以忽略;注意:一定要制冷!

    2. 要进行定量分析,要求图像信噪比至少要大于5:1, 即信号要高于25e- (参考: 做成像的你不能不了解的真相3- 信噪比2)

      接下来,让我们来看看有什么办法可以拯救下面这张图像吧:

     

    当前图像: 曝光时间1ms, 典型信号强度 5e-. 

     

    方法1:增加曝光时间

           假设曝光时间提高为原来的 n 倍,那么信噪比变为:

    结果图像: 曝光时间10ms, 典型信号强度 50e-. 

     

    方法 2:多帧图像平均

           对 n 张图像做平均,结果图像的信噪比为:

     

    结果图像: 平均10张1ms曝光时间的图像.

      大家不难发现,在弱光条件下,提高曝光时间的效果要优于图像平均。

     

     

    小 结

    • 在读出噪声不能忽略的弱光情况下(如对于读出噪声为1.5e-左右的 sCMOS 相机,当信号<10e-时),将曝光时间延长n倍的效果比平均n张图像好。信号越弱,或读出噪声越大,两者的差别就越明显。

    • 在信号较强时(如 sCMOS相机信号>20e-时),可以忽略读出噪声,两种方法对信噪比的提高效果相同。

    • 由于CCD的读出噪声比较高(~8e-),使用图像平均的效果不如CMOS好。

    方法 3:像素融合Binning

           Binning是用来提高信噪比的常见方法。CCD的Binning 发生在读出之前,因此不会改变读出噪声。以bin 2(2x2)为例,其对信噪比的改善为:

     结果恰好和曝光时间延长为原来4倍一样。

           而CMOS的binning是在读出之后完成的,相当于4个像素相加,读出噪声也会提高。

       这个结果和 4 张图像平均一样。

     

           是不是非常神奇?让我们直观的看一下bin 2 的效果:

      可以看到,bin 2 明显提高了信噪比,但分辨率降低了。

    方法 4:使用QE更高的相机 (背照式 95% vs 前照式 65%)

           背照式sCMOS QE 高达95%,而前照式sCMOS在显微成像中实际测量的有效QE只有65%左右(波长和物镜不同时稍有变化,详情参见做成像的你不得不了解的真相2-灵敏度和QE)。两种相机的信噪比差别为:

    像元尺寸相同的情况下,背照式相机信噪比是前照式的1.2倍

     

    方法5:使用像元尺寸更大的相机(11²μm vs 6.5²μm)

           像元尺寸大,则信号收集能力更强。如果我们比较11²μm像元和6.5²μm像元相机的信噪比:

     11²μm像元信噪比是6.5²μm的1.7倍。

    小 结

    如果我们使用95%QE,11²μm像元的Prime 95B与流行的正照式6.5²μm像元的 sCMOS相机相比,其信噪比差别为:

     

           通过以上的分析我们会发现,其实对信噪比影响最大的噪声是散粒噪声,它是一种固有的物理现象。那么是不是我们对它就束手无策了呢?当然不是!

     

    注意!接下来的绝不是广告

     

    Photometrics sCMOS相机内置denoising功能,可以大大降低散粒噪声,显著提高图像信噪比

    Photometrics 在噪声控制方面一直是业内的佼佼者, Prime 95B和Prime BSI都内置了最先进的denoising技术,它采用先进的内嵌图像算法,对单帧图像实时处理,在降低图像噪声的同时,不影响信号强度,保证了图像的可定量性。平均可将图像的信噪比提高3-5倍,相当于增加10倍以上曝光时间的效果。对比下图中使用denoising功能前后的图像,我们可以很明显的看到信噪比的提高,下方的线强度曲线(line profile)也充分展现了denoising功能优异的降噪效果。

     

      由于计算量大,虽然通过高级优化的FPGA图像算法,denoising仍然在一定程度上降低了相机速度。以95B为例,全帧采集速度会从40帧/s下降到25帧/s。

      好啦,说了这么多,希望能对大家拍出信噪比更高的图像有所帮助!其实无论采用哪种技术来提高信噪比,灵敏度高的相机总是首选,毕竟巧妇难为无米之炊呀!

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