1.What is Cygwin ?
- a large collection of GNU and Open Source tools which provide functionality similar to a Linux distribution on Windows.
- a DLL (cygwin1.dll) which provides substantial POSIX API functionality.
Cygwin is a unix-like enviroment and command-line interface for microsoft windows. It consists of two parts: A DLL (cygwin1.dll) which acts as a Linux API emulation layer providing substantial Linux API functionality.
A collection of tools which provide Linux look and feel.
The Cygwin DLL currently works with all recent, commercially released x86 32 bit and 64 bit versions of Windows, with the exception of Windows CE.
Note that the official support for Windows 95, Windows 98, and Windows Me will be discontinued with the next major version (1.7.0) of Cygwin.
Cygwin is huge and includes most of the Unix tools and utilities. It also include the commonly used Bash shell.
A collection of tools which provide Linux look and feel.
The Cygwin DLL currently works with all recent, commercially released x86 32 bit and 64 bit versions of Windows, with the exception of Windows CE.
Note that the official support for Windows 95, Windows 98, and Windows Me will be discontinued with the next major version (1.7.0) of Cygwin.
What Isn't Cygwin?
- Cygwin is not a way to run native linux apps on Windows. You have to rebuild your application from source if you want it to run on Windows.
- Cygwin is not a way to magically make native Windows apps aware of UNIX ? functionality, like signals, ptys, etc. Again, you need to build your apps from source if you want to take advantage of Cygwin functionality.
- cygwin不是让linux程序能在windows上运行的方法，如果你想要让linux程序能在windows运行，那么你只有用cygwin来重新编译一下源文件。
这句话完全反驳了无缝运行在linux的说法。就是说你在linux上编译的elf程序不能直接拿到cygwin上运行，同样，你用cygwin编译的程序也不是linux的elf格式，而是exe格式，exe是无法在linux上运行的。
Official Website:http://www.cygwin.com/
2.What is MinGW?
- MinGW, a contraction of "Minimalist GNU for Windows", is a minimalist development environment for native Microsoft Windows applications.1.What is Cygwin ?
- MinGW provides a complete Open Source programming tool set which is suitable for the development of native MS-Windows applications, and which do not depend on any 3rd-party C-Runtime DLLs. (It does depend on a number of DLLs provided by Microsoft themselves, as components of the operating system; most notable among these is MSVCRT.DLL, the Microsoft C runtime library. Additionally, threaded applications must ship with a freely distributable thread support DLL, provided as part of MinGW itself).
- MinGW: A collection of freely available and freely distributable Windows specific header files and import libraries combined with GNU toolsets that allow one to produce native Windows programs that do not rely on any 3rd-party C runtime DLLs.
- Official Website:http://www.mingw.org/
MinGW：根据我的理解，它是一个Windows下的编译器。与Windows下其它编译器不同的是，MinGW与Linux下广泛使用的GNU（基本上）完全兼容，这意味着，在Linux下如何编译源代码，在MinGW中也可以以完全相同的方式编译。
例如wxWidgets-2.6.2在Windows下的编译方式：
用VC编译的话，有两种方式：VC工程，Makefile。前者就不用说了，用VC打开*.dsw文件，F7就可以了。这里说一下Makefile的编译方式，首先进入命令行窗口（cmd.exe 或 command.exe），切换路径到wxWidgets源代码所在目录下的 build/msw 子目录，执行“nmake -f makefile.vc”即可。
用MinGW编译的话，基本上与前面类似，也是进入命令行窗口（cmd.exe 或 command.exe），切换路径到wxWidgets源代码所在目录下的 build/msw 子目录，只是执行的命令行是“mingw32-make -f makefile.gcc”。最终生成的库文件位于lib目录中。当然，编译之前可能需要设置一下，比如指定编译为动态库（DLL）还是静态库（LIB），或者是否采用UNICODE，等等，设置方式就是修改 build/msw 子目录中的 config.vc 或 config.gcc 文件。
VC6和MinGW相比，两者在编译速度，以及在编译后的文件的大小方面都有较大不同。根据我编译wxWidgets时所做的简单统计，VC6的编译速度比MinGW至少快一倍，VC6编译生成的动态库DLL文件比MinGW小一倍左右，VC6编译生成的静态库LIB文件比MinGW要大不少（大约是1.5倍）。
总起来说，在Windows系统下，还是用VC编译比较合适，没办法的情况下才会选择MinGW。
3.Different Between Cygwin And MinGw
两者出现的背景：
Unix下编译通过的C代码,在win32下编译是不能通过的 ,当然Unix 和win32的API都是符合标准C,也就是说,大多数函数调用在unix和win32下是相同的.但是,unix有自己一些独特的API（如fork,spawn,signals,select,sockets等）,如果代码中使用了这些API,在win32下当然找不到对应的库.
但是,这些API的功能在win32中也能实现,也许你已经发现了一个能让window编译Unix风格代码的方法:
1.修改编译器,让window下的编译器把诸如fork的调用翻译成等价的形式--这就是mingw的做法.
2.修改库,让window提供一个类似unix提供的库,他们对程序的接口如同unix一样,而这些库,当然是由win32的API实现的--这就是cygwin的做法.
MinGW的出现是有原因的：有些Linux下的开发人员（比如开源阵营）发布的源代码通常只提供Linux下的编译方式，而不提供Windows下的编译方式，但确实有不少用户需要在在Windows下编译使用此源代码。这在种情况下，如果Windows用户想用VC、BC等编译器编译该源代码，必须重写Makefile（各种编译器所支持的Makefile不尽相同），工作量比较大不说，还很难保证不出错。MinGW的出现，提供了两个平台下的“跨平台编译方案”。MinGW与MSYS相配合，连./configure都有了。与GNU不同的是，MinGW编译生成的是Windows下的可执行文件（.exe）或库文件（.dll,.lib）——不过编译过程中的的中间文件仍然是.o文件，而不是.obj文件。
首先MingW和cygwin都可以用来跨平台开发。
MinGW是Minimalistic GNU for Windows的缩写，也就是Win版的GCC。
Cygwin则是全面模拟了Linux的接口，提供给运行在它上面的的程序使用，并提供了大量现成的软件，更像是一个平台。
相对的MingW也有一个叫MSys（Minimal SYStem）的子项目，主要是提供了一个模拟Linux的Shell和一些基本的Linux工具。因为编译一个大型程序，光靠一个GCC是不够的，还需要有Autoconf等工具来配置项目，所以一般在Windows下编译ffmpeg等Linux下的大型项目都是通过Msys来完成的，当然Msys只是一个辅助环境，根本的工作还是MingW来做的。
用MingW和cygwin编译出来的程序的区别。
首先MingW和cygwin都不能让Linux下的程序直接运行在Windows上，必需通过源代码重新编译。
现代操作系统包括Windows和Linux的基本设计概念像进程线程地址空间虚拟内存这些都是大同小异的，之所以二者上的程序不能兼容，主要是它们对这些功能具体实现上的差异，首先是可执行文件的格式，Window使用PE的格式，并且要求以.EXE为后缀名。Linux则使用Elf。其次操作系统的API也不一样，如Windows用CreateProcess()创建进程，而Linux使用fork()。
所以要移植程序必然要在这些地方进行改变，MingW有专门的W32api头文件，来把代码中Linux方式的系统调用替换为对应的Windows方式。而Cygwin则通过cygwin1.dll这个文件来实现这种API的转换，并模拟一个Linux系统调用接口给程序，程序依然以Linux的方式调用系统API，只不过这个API在cygwin1.dll上，cygwin1.dll再调用Windows对应的实现，来把结果返回给程序。
可以用查看他们编译好的程序的导入表来验证这点。
二者生成的程序都是能在Windows上运行的EXE文件，显然都是PE格式，用一个PE格式查看工具检查一下就能发现，Cygwin生成的程序依然有fork()这样的Linux系统调用，但目标库是cygwin1。而MingW生成的程序，则全部使用从KERNEL32导出的标准Windows系统API。
这样看来用Mingw编译的程序性能会高一点，而且也不用带着那个接近两兆的cygwin1.dll文件。
但Cygwin对Linux的模拟比较完整，甚至有一个Cygwin X的项目，可以直接用Cygwin跑X。
另外Cygwin可以设置-mno-cygwin的flag，来使用Mingw编译。
而与Cygwin更有可比性的MSys上的工具也是通过Cygwin这种模拟的方式来提供的。
总之这两个项目有千丝万缕的关系，一个不恰当的比方，如果Mingw是MFC，Cygwin就是.NET了。
4.How to choose Between Cygwin And MinGw ?
MinGW相比CygWin/gcc来讲，更加贴近win32。因为它几乎支持所有的Win32API。它所连接的程序，不需要任何第三方库即可运行。
CygWin/gcc，其实这是两个东西。CygWin是一个让Windows拥有Unix-like环境的软件。而gcc就是安装在CygWin上的编译器。
CygWin/gcc与MinGW的最大区别在于：使用CygWin/gcc可以在Windows下调用unix-like的API，（如fork,spawn,signals,select,sockets等）。也就是说Cygwin是运行在Windows下的，但是她使用的是Unix-like系统的函数和思想。由于这个区别，导致的结果就是用CygWin/gcc编译出来的程序可以无缝的运行在*nix环境下。但是如果调用了unix特有的API函数，在windows环境下不能正常运行，如果想在windows下正常运行的，就必须依赖cygwin1.dll，速度上会有些影响。
而用MinGW编译出来的程序，如果源代码里面调用了unix环境的API，则MinGW会把这些对UNIX的API调用翻译成win32下等价的形式。同时这个程序是不能在windows下运行的。
如果你是想在windows环境下开发linux运行程序，那么CygWin/gcc是你的不二之选。
而如果你想开发的是windows运行程序，并且追求速度，那么二者相比而言，MinGW是更好的选择
cygwin和mingw都是为用户提供在windows操作系统使用GNU工具的方法，使得在windows上可以编译为linux写的c源代码并运行。真正的不同在于
1，cygwin大，mingw小
2，cygwin编译后的exe需要cygwin1.dll作为支持，而mingw不需要就可以直接运行，因为有中间层所以cygwin慢，mingw快。
3，cygwin包含的内容更全面，能编译通过的linux源文件更多，mingw的min是minimalist所以能编译通过的更少。但，不是全部，就是说别指望你可以把任何为linux写的源代码在cygwin或mingw编译通过并运行。