jena读取和解析本体文件

使用jena开发本体应用程序时，首先需要对我们利用本体构建工具，如protege等，构建的本体文件，如owl、rdf等读取并解析得到本体模型。下面给出相应的代码，不对的地方请指正。

（基于jena 2.13.0，jena 3 需要java 1.8）

方式一：使用RDFDataMgr

    /**
     * 使用RDFDataMgr读取RDF文件
     * 
     * @param fileName URI或 file:filename形式路径
     * @return
     */
    public static OntModel openRDFFile(String fileName)
    {
        OntModel model = ModelFactory.createOntologyModel(OntModelSpec.OWL_MEM);
        RDFDataMgr.read(model, fileName);
        return model;
    }

方式二：使用FileManager

    /**
     * 打开并读取RDF文件
     * 
     * @param fileName
     * @return
     */public static OntModel openRdfFile(String fileName)
    {
        OntModel model = ModelFactory.createOntologyModel(OntModelSpec.OWL_MEM);
        InputStream in = FileManager.get().open(fileName);
        OntModel baseOntModel = null;
        if (in != null)
        {
            baseOntModel = (OntModel) model.read(in, "");
        }
        return baseOntModel;
    }

上面两种方式都没有处理本体导入（import）问题，也即不能同时读取你在构建本体时引入的其他本体文件。为了处理引用的本体，本人目前发现最好的方式是使用配置文件：location-mapping.ttl

@prefix rdf:        <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix rdfs:        <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix xsd:        <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
@prefix lm:         <http://jena.hpl.hp.com/2004/08/location-mapping#> .

# 地址映射
# Application location to alternative location mappings.
# + name 指本体本体文件的uri。可以是http开头的url，也可以是file:开头的文件地址。引入文件中的name一般是uri
# + altName 指文件实际的地址，可以是file:开头的本地文件，或网络地址
# + 顺序无关.
# 
# The translation algorithm is:
#
# 1 - Exact mappings: these are tried before attempting a prefix match.
# 2 - By prefix: find the longest matching prefix
# 3 - Use the original if no alternative.

[] lm:mapping    
   [ 
     lm:prefix "GTS" ; 
     lm:altPrefix "http://www.geodataont.cn/support/geology/gts" 
   ],
   [ 
     lm:name "http://www.geodataont.cn/support/geology/gts" ;
     lm:altName "file:*/GTS.owl" # 请将*替换为文件目录
   ]

注：prefix部分我暂时没明白啥意思，不一定是对的

prefix部分补充：当利用 lm:altName 找不到对应文件时，会查找与lm:name匹配的最长的lm:prefix，利用其lm:altPrefix和lm:altName组合到一起最为地址去查找文件。

若有：

lm:name "http://www.geodataont.cn/support/geology/gts/a.owl" ;
lm:altName "file:*/a.owl"

则可以配置为：

lm:prefix "http://www.geodataont.cn/support/geology/gts" ; 
lm:altPrefix "file:*/" 

lm:name "http://www.geodataont.cn/support/geology/gts/a.owl" ;
lm:altName "a.owl" 

（2016-04-09）

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补充（2017-05-08）：Jena中处理prefix的部分代码存在bug，本人已在在stackoverflow指出： http://stackoverflow.com/questions/43680583/how-to-use-prefix-and-altprefix-in-location-mapping-ttl-to-load-owl-file

因此，目前此部分尚不能使用

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相应的代码如下

    /**
     * 读取本体，使用location-mapper确定引用文件地址
     * 
     * @param locMapperPath
     * @param baseOntPath 读取的本体文件路径
     * @return
     */
    public static OntModel loadOntModelWithLocMapper(String locMapperPath, String baseOntPath)
    {
        OntModel model = ModelFactory.createOntologyModel();

        LocationMapper locMapper = readLocationMapper(locMapperPath);

        model.getDocumentManager().setProcessImports(true);
        FileManager fileManager = model.getDocumentManager().getFileManager();
        fileManager.setLocationMapper(locMapper);
        baseOntPath = StringUtil.getUriFilePath(baseOntPath);// 添加file:，替换
        fileManager.readModel(model, baseOntPath);
        model.loadImports();

        return model;
    }

其中getUriFilePath是将文件地址进行转换，方便读取

public static String getUriFilePath(String filepath)
    {
        if (filepath.startsWith("file:") || filepath.startsWith("http://"))
        {
            return filepath;
        }
        else
        {
            filepath = "file:" + filepath;
            filepath = filepath.replaceAll("\\", "/");
            return filepath;
        }
    }

目前基本功能就是这样，详细内容参考jena的文档。不对的地方一起讨论