依据开发所处的层次以及开发工具的不同，能够将嵌入式系统开发分为系统开发和应用开发。
系统开发所涉及的内容包含三个方面：系统定制。驱动程序开发。操作系统一致（BSP开发）。
一系统开发
（1） 系统定制
首先是依照bsp（即导入cec文件）。bsp能够是pb自带。也但是从oem硬件厂商获得。当然用户也能够自己开发，但是难度较高且工作量较大，比較耗时。其次。定制操作系统，即生成系统镜像NK.bin文件。将该镜像下载并调试，包含仿真和目标板两种执行环境。
（2） 驱动程序开发
普通操作系统的驱动模型包括两种模式：一是静态链接，驱动程序编写成*.lib文件并与操作系统内核链接，形成一个总体，对操作系统一起启动载入；二是动态链接。操作系统在启动后对硬件驱动延迟载入，可是依旧载入到操作系统的内核空间中。
（3） 操作系统的移植（bsp开发）
Bsp是介于主板硬件和操作系统之间的一层软件系统。开发bsp的内容主要包含：bootloader开发和OAL开发。
二应用开发
（1）api的选择
Windows ce.net为应用程序开发者提供了三种api 的选择：win32应用程序编程接口（Win32 API），微软基础类（MFC）和活动模板库（ATL），NET Framework精简版（.NET CF）。
对于开发工具，开发者能够选择Embedded VC++或者Visual Studio等。以下就三种api做下介绍。
Win32：能够生成最小的和最快的*.exe文件和*.dll文件。最低的内存负载；经常使用于驱动程序。控制模板applets以及shell扩展；没有执行似的要求。
MFC：基于面向对象的思想：继承性，封装性和多态性；累的支持；类型定义的安全性。能够实现完整的MFC/ATL源码移植；良好的工具支持。
.NET Framework：设计良好的编程接口；相同基于面向对象的思想：继承性。封装性，多态性；类的支持：数组，列表，hash表，字典，堆栈；类型定义的安全性；支持命名空间。内存的自己主动回收；webservice支持；对xml处理的良好支持；良好的工具支持。
（2）开发工具
主要开发工具有两大类：platform builder和windows ce ApplicationFrameworks。