blast的原理就是将想要明确注释的sequence（这个sequence就是query）先打断，即一条sequence变成多条sub-sequence（sub-sequence也就是word），然后拿这些sub-sequence与数据库中的序列比较（数据库中的序列是已经注释过的），然后将这些word向两边延展，延展方式是将单个word（就是图中黄色的线）对应的sequence（就是图中黑色的线）保持不变，拿其他word的信息mapping到黑色线上。
联系到实际实验就是，我手头的pep文件中的34条蛋白质序列就是34个query(就是黄色线)，在blast中，先将这34条序列每一条都打断，然后与斑马雀.fa的数据库（就是黑色线）相互匹配，所以得到的结果是某一条scaffold（黑色线）与某一个gene（黄色线）的匹配情况。目的是想知道在某个物种中，某些gene的分布情况。
由此产生的gff文件中的内容是：
1.scaf_id
2.gene_name
3.scaf_len（整个一条sacffold的length）
4.sacf_start（可以mapping到这个gene_name的word的起始位点）
5.scaf_end（可以mapping到这个gene_name的word的终止位点，scaf_start与scaf_end之间的内容包括了exon和intron）
6.block_number(是scaf_start与scaf_end之间的gene_name的exon个数)
7.block_start(某个block的起始位点，此处可能有多个，如果block_number是3，则有3个block，也就有3个block_start)
8.block_end(某个block的终止位点，此处可能有多个，如果block_number是3，则有3个block，也就有3个block_end)
9.identify(某个block的identify，此处可能有多个，如果block_number是3，则有3个block，也就有3个identify)
10.align_rate