Debian Linux JRE 默认是GCJ(GNU Compiler for Java):
bl25p-18:~# java -version
java version "1.5.0"
gij (GNU libgcj) version 4.3.2
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而 Eclipse在GCJ上运行是没有测试的（提示信息原文为：Eclipse on GCJ is untested, Plsea see the linux Known Issues document）.这里安置的Eclipse版本为Eclipse Helios(3.6.1). 推荐的Java平台为Sun, IBM, 或BEA JVM.
所以要安装Eclipse，先安装Sun的J2SE。
在我的系统上，通过aptitude install sun-java5-jdk 可以安装需要的JDK和JRE。安装完成后，可以在/usr/lib/jvm/java-1.5.0-sun/查看安装完成后具体文件结构。
接下来就可以在Eclipse官网（www.eclipse.org）上，选择下载并且安装对应你当前平台的Eclipse。
Debian Linux 下安装eclipse比较简单，将下载的eclipse.tar.gz 解压，就可以使用了。 在正式运行eclipse之前，先编辑下clipse.ini文件，以确保你使用了正确的JDK.
cat eclipse.ini
-startup
plugins/org.eclipse.equinox.launcher_1.1.0.v20100507.jar
--launcher.library
plugins/org.eclipse.equinox.launcher.gtk.linux.x86_1.1.1.R36x_v20100810
-product
org.eclipse.epp.package.jee.product
--launcher.defaultAction
openFile
-showsplash
org.eclipse.platform
--launcher.XXMaxPermSize
256m
--launcher.defaultAction
openFile
-vm
/usr/lib/jvm/java-1.5.0-sun/bin/java
-vmargs
-Dosgi.requiredJavaVersion=1.5
-XX:MaxPermSize=256m
-Xms40m
-Xmx512m
如上，标红部分指定了vm是sun-java,而不是GCJ。