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  • 大数据算法系列——布隆过滤器

    一、简介

    Bloom filter介绍

    Bloom Filter(BF)是一种空间效率很高的随机数据结构,它利用位数组很简洁地表示一个集合,并能判断一个元素是否属于这个集合。它是一个判断元素是否存在集合的快速的概率算法。Bloom Filter有可能会出现错误判断,但不会漏掉判断。因此,Bloom Filter不适合那些“零错误”的应用场合。而在能容忍低错误率的应用场合下,Bloom Filter比其他常见的算法(如hash,折半查找)极大节省了空间。它的优点是空间效率和查询时间都远远超过一般的算法,缺点是有一定的误识别率和删除困难。

    二、算法思想

    Bloom-Filter算法的核心思想就是利用多个不同的Hash函数来解决“冲突”。
    计算某元素x是否在一个集合中,首先能想到的方法就是将所有的已知元素保存起来构成一个集合R,然后用元素x跟这些R中的元素一一比较来判断是否存在于集合R中;我们可以采用链表等数据结构来实现。但是,随着集合R中元素的增加,其占用的内存将越来越大。试想,如果有几千万个不同网页需要下载,所需的内存将足以占用掉整个进程的内存地址空间。即使用MD5,UUID这些方法将URL转成固定的短小的字符串,内存占用也是相当巨大的。
    于是,我们会想到用Hash table的数据结构,运用一个足够好的Hash函数将一个URL映射到二进制位数组(位图数组)中的某一位。如果该位已经被置为1,那么表示该URL已经存在。
    但是Hash存在一个冲突(碰撞)的问题,用同一个Hash得到的两个URL的值有可能相同。为了减少冲突,我们可以多引入几个Hash,如果通过其中的一个Hash值我们得出某元素不在集合中,那么该元素肯定不在集合中。只有在所有的Hash函数告诉我们该元素在集合中时,才能确定该元素存在于集合中。这便是Bloom-Filter的基本思想。

    三、过程

    工具:一个位数组、K个独立hash函数

    1)位数组:
    假设Bloom Filter使用一个m比特的数组来保存信息,初始状态时,Bloom Filter是一个包含m位的位数组,每一位都置为0,即BF整个数组的元素都设置为0。

    0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

    2)添加元素,k个独立hash函数

    为了表达S={x1, x2,…,xn}这样一个n个元素的集合,Bloom Filter使用k个相互独立的哈希函数(Hash Function),它们分别将集合中的每个元素映射到{1,…,m}的范围中。

    当我们往Bloom Filter中增加任意一个元素x时候,我们使用k个哈希函数得到k个哈希值(可以对应数组下标),然后将数组中对应的比特位设置为1。即第i个哈希函数映射的位置hashi(x)就会被置为1(1≤i≤k)。

    注意,如果一个位置多次被置为1,那么只有第一次会起作用,后面几次将没有任何效果。在下图中,k=3,且有两个哈希函数选中同一个位置(从左边数第五位,即第二个“1“处)。

    3)判断元素是否存在集合

    在判断y是否属于这个集合时,我们只需要对y使用k个哈希函数得到k个哈希值,如果所有hashi(y)的位置都是1(1≤i≤k),即k个位置都被设置为1了,那么我们就认为y是集合中的元素,否则就认为y不是集合中的元素。下图中y1就不是集合中的元素(因为y1有一处指向了“0”位)。y2或者属于这个集合,或者刚好是一个false positive。

    很显然这个判断并不能保证查找的结果是100%正确的。

    四、数学理论

    参数:

    m:bit数组的宽度(bit数)

    n:加入其中的key的数量

    k:使用的hash函数的个数

    f:false positive的比率

    则BF满足下面的数学公式:

    在给定m和n时,能够使f最小化的k值为:

    此时给出的f为:

    根据上述的理论可以推出:

    a、对于给定的f,则有:n = m ln(0.6185) / ln(f)

    b、同时需要用k个hash函数来实现目标:k = - ln(f) / ln(2)

    c、k必须取整,那么需要f = (1 – e-kn/m)k 求实际值

    五、缺陷

    1)Bloom Filter无法从Bloom Filter集合中删除一个元素。因为该元素对应的位会牵动到其他的元素。所以一个简单的改进就是 counting Bloom filter,用一个counter数组代替位数组,就可以支持删除了。 此外,Bloom Filter的hash函数选择会影响算法的效果。

    2)还有一个比较重要的问题,如何根据输入元素个数n,确定位数组m的大小及hash函数个数,即hash函数选择会影响算法的效果。当hash函数个数k=(ln2)*(m/n)时错误率最小。在错误率不大于E的情况 下,m至少要等于n*lg(1/E) 才能表示任意n个元素的集合。但m还应该更大些,因为还要保证bit数组里至少一半为0,则m应 该>=nlg(1/E)*lge ,大概就是nlg(1/E)1.44倍(lg表示以2为底的对数)。
    举个例子我们假设错误率为0.01,则此时m应大概是n的13倍。这样k大概是8个。(PS:这里m与n的单位不同,m是bit为单位,而n则是以元素个数为单位(准确的说是不同元素的个数)。通常单个元素的长度都是有很多bit的。所以使用bloom filter内存上通常都是节省的。 )

    一般BF可以与一些key-value的数据库(如redis)一起使用,来加快查询。由于BF所用的空间非常小,所有BF可以常驻内存。这样子的话,对于大部分不存在的元素,我们只需要访问内存中的BF就可以判断出来了,只有一小部分,我们需要访问在硬盘上的key-value数据库。从而大大地提高了效率。

    六、应用

    1、垃圾邮件过滤

    像网易、腾讯等公众电子邮件(email)提供商,总是需要过滤来自发送垃圾邮件的人(spamer)的垃圾邮件。一个办法就是记录下那些发垃圾邮件的 email地址。由于那些发送者不停地在注册新的地址,全世界少说也有几十亿个发送垃圾邮件的地址,将他们都存起来则需要大量的网络服务器。如果用哈希表,每存储一亿个 email地址,就需要 1.6GB的内存(用哈希表实现的具体办法是将每一个 email地址对应成一个八字节的信息指纹,然后将这些信息指纹存入哈希表,由于哈希表的存储效率一般只有 50%,因此一个 email地址需要占用十六个字节。一亿个地址大约要 1.6GB,即十六亿字节的内存)。因此存贮几十亿个邮件地址可能需要上百GB的内存。而Bloom Filter只需要哈希表 1/8到 1/4 的大小就能解决同样的问题。BloomFilter决不会漏掉任何一个在黑名单中的可疑地址。而至于误判问题,常见的补救办法是在建立一个小的白名单,存储那些可能别误判的邮件地址

    2、网络应用

    1)P2P网络中查找资源操作,可以对每条网络通路保存Bloom Filter,当命中时,则选择该通路访问。

    2)广播消息时,可以检测某个IP是否已发包。

    3)检测广播消息包的环路,将Bloom Filter保存在包里,每个节点将自己添加入Bloom Filter。

    4)信息队列管理,使用Counter Bloom Filter管理信息流量。

    3、Hbase底层

    Hbase也使用了Bloom Filter,以减少不存在的行或列在磁盘上的查询,大大提高了数据库的查询操作的性能。

    七、java实现

    package fuyunnet.com;
    import java.io.BufferedReader;
    import java.io.FileReader;
    import java.io.IOException;
    import java.util.ArrayList;
    import java.util.BitSet;
    import java.util.List;
    public class Bloomfilter {
        private BitSet bitSet;
        private int bitSetSize;
        private int addedElements;
        private int hashFunctionNumber;
        /**
         * 构造一个布隆过滤器,过滤器的容量为c * n 个bit.
         * @param c 当前过滤器预先开辟的最大包含记录,通常要比预计存入的记录多一倍.
         * @param n 当前过滤器预计所要包含的记录.
         * @param k 哈希函数的个数,等同每条记录要占用的bit数.
         */
        public Bloomfilter(int c, int n, int k) {
            this.hashFunctionNumber = k;
            this.bitSetSize = (int) Math.ceil(c * k);
            this.addedElements = n;
            this.bitSet = new BitSet(this.bitSetSize);
        }
        /**
         * 通过文件初始化过滤器.
         * @param file
         */
        public void init(String file) {
            BufferedReader reader = null;
            try {
                reader = new BufferedReader(new FileReader(file));
                String line = reader.readLine();
                while (line != null && line.length() > 0) {
                    this.put(line);
                    line = reader.readLine();
                }
            } catch (Exception e) {
                e.printStackTrace();
            } finally {
                try {
                    if (reader != null) reader.close();
                } catch (IOException e) {
                    e.printStackTrace();
                }
            }
        }
        public void put(String str) {
            int[] positions = createHashes(str.getBytes(), hashFunctionNumber);
            for (int i = 0; i < positions.length; i++) {
                int position = Math.abs(positions[i] % bitSetSize);
                bitSet.set(position, true);
            }
        }
        public boolean contains(String str) {
            byte[] bytes = str.getBytes();
            int[] positions = createHashes(bytes, hashFunctionNumber);
            for (int i : positions) {
                int position = Math.abs(i % bitSetSize);
                if (!bitSet.get(position)) {
                    return false;
                }
            }
            return true;
        }
        /**
         * 得到当前过滤器的错误率.
         * @return
         */
        public double getFalsePositiveProbability() {
            // (1 - e^(-k * n / m)) ^ k
            return Math.pow((1 - Math.exp(-hashFunctionNumber * (double) addedElements / bitSetSize)),
                    hashFunctionNumber);
        }
        /**
         * 将字符串的字节表示进行多哈希编码.
         * @param bytes 待添加进过滤器的字符串字节表示.
         * @param hashNumber 要经过的哈希个数.
         * @return 各个哈希的结果数组.
         */
        public static int[] createHashes(byte[] bytes, int hashNumber) {
            int[] result = new int[hashNumber];
            int k = 0;
            while (k < hashNumber) {
                result[k] = HashFunctions.hash(bytes, k);
                k++;
            }
            return result;
        }
        public static void main(String[] args) throws Exception {
            Bloomfilter bloomfilter = new Bloomfilter(30000000, 10000000, 8);
            System.out.println("Bloom Filter Initialize ... ");
            bloomfilter.init("data/base.txt");
            System.out.println("Bloom Filter Ready");
            System.out.println("False Positive Probability : "
                    + bloomfilter.getFalsePositiveProbability());
            // 查找新数据
            List<String> result = new ArrayList<String>();
            long t1 = System.currentTimeMillis();
            BufferedReader reader = new BufferedReader(new FileReader("data/input.txt"));
            String line = reader.readLine();
            while (line != null && line.length() > 0) {
                if (!bloomfilter.contains(line)) {
                    result.add(line);
                }
                line = reader.readLine();
            }
            reader.close();
            long t2 = System.currentTimeMillis();
            System.out.println("Parse 9900000 items, Time : " + (t2 - t1) + "ms , find "
                    + result.size() + " new items.");
            System.out.println("Average : " + 9900000 / ((t2 - t1) / 1000) + " items/second");
        }
    }
    class HashFunctions {
        public static int hash(byte[] bytes, int k) {
            switch (k) {
                case 0:
                    return RSHash(bytes);
                case 1:
                    return JSHash(bytes);
                case 2:
                    return ELFHash(bytes);
                case 3:
                    return BKDRHash(bytes);
                case 4:
                    return APHash(bytes);
                case 5:
                    return DJBHash(bytes);
                case 6:
                    return SDBMHash(bytes);
                case 7:
                    return PJWHash(bytes);
            }
            return 0;
        }
        public static int RSHash(byte[] bytes) {
            int hash = 0;
            int magic = 63689;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                hash = hash * magic + bytes[i];
                magic = magic * 378551;
            }
            return hash;
        }
        public static int JSHash(byte[] bytes) {
            int hash = 1315423911;
            for (int i = 0; i < bytes.length; i++) {
                hash ^= ((hash << 5) + bytes[i] + (hash >> 2));
            }
            return hash;
        }
        public static int ELFHash(byte[] bytes) {
            int hash = 0;
            int x = 0;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                hash = (hash << 4) + bytes[i];
                if ((x = hash & 0xF0000000) != 0) {
                    hash ^= (x >> 24);
                    hash &= ~x;
                }
            }
            return hash;
        }
        public static int BKDRHash(byte[] bytes) {
            int seed = 131;
            int hash = 0;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                hash = (hash * seed) + bytes[i];
            }
            return hash;
        }
        public static int APHash(byte[] bytes) {
            int hash = 0;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                if ((i & 1) == 0) {
                    hash ^= ((hash << 7) ^ bytes[i] ^ (hash >> 3));
                } else {
                    hash ^= (~((hash << 11) ^ bytes[i] ^ (hash >> 5)));
                }
            }
            return hash;
        }
        public static int DJBHash(byte[] bytes) {
            int hash = 5381;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                hash = ((hash << 5) + hash) + bytes[i];
            }
            return hash;
        }
        public static int SDBMHash(byte[] bytes) {
            int hash = 0;
            int len = bytes.length;
            for (int i = 0; i < len; i++) {
                hash = bytes[i] + (hash << 6) + (hash << 16) - hash;
            }
            return hash;
        }
        public static int PJWHash(byte[] bytes) {
            long BitsInUnsignedInt = (4 * 8);
            long ThreeQuarters = ((BitsInUnsignedInt * 3) / 4);
            long OneEighth = (BitsInUnsignedInt / 8);
            long HighBits = (long) (0xFFFFFFFF) << (BitsInUnsignedInt - OneEighth);
            int hash = 0;
            long test = 0;
            for (int i = 0; i < bytes.length; i++) {
                hash = (hash << OneEighth) + bytes[i];
                if ((test = hash & HighBits) != 0) {
                    hash = (int) ((hash ^ (test >> ThreeQuarters)) & (~HighBits));
                }
            }
            return hash;
        }
    }
    

      

    八、问题抛出

    最后抛出搜索引擎领域的一个问题:

    给你A,B两个文件,各存放50亿条URL,每条URL占用64字节,内存限制是4G,让你找出A,B文件共同的URL。如果是三个乃至n个文件呢? 

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