参考这个博客
http://www.cnblogs.com/wangtianxj/archive/2010/06/13/1757639.html
http://blog.csdn.net/bupt073114/article/details/42298337
APK文件结构：
AndroidManifest.xml 配置清单
META-INF 签名
assets 资源
classes.dex java经过源码编译后生成的java字节码文件
res 资源库
lib native 动态库 so
smali classes.dex
resources.arsc 记录这些ID和资源文件位置对应关系的文件
apktool.yml 重新打包必须文件
META-INF目录：存放的是签名信息，用来保证apk包的完整性和系统的安全。
在编译生成一个api包时，会对所有要打包的文件做一个校验计算，并把计算结果放在META-INF目录下。在安装时，如果校验结果与META-INF下的内容不一致，系统就不会安装这个apk。保证了apk包里的文件不能被随意替换。
META-INF目录下包含的文件有CERT.RSA，CERT.DSA，CERT.SF和MANIFEST.MF。
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CERT.RSA |
是开发者利用私钥对APK进行签名的签名文件 |
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CERT.SF,MANIFEST.MF |
记录了文件中文件的SHA-1哈希值 |
assets目录：用于存放需要打包到APK中的静态文件
assets目录支持任意深度的子目录，用户可以根据自己的需求任意部署文件夹架构。
而且res目录下的文件会在.R文件中生成对应的资源ID，assets不会自动生成对应的ID，访问的时候需要AssetManager类。
lib目录：这里存放应用程序依赖的native库文件，一般是用C/C++编写，这里的lib库可能包含4中不同类型，根据CPU型号的不同，大体可以分为ARM架构，ARM-V7a架构，MIPS架构和X86架构。
不同的CPU架构对应着不同的目录，目前市场上使用的移动终端大多是基于ARM或者ARM-V7a架构的，X86和MIPS架构的移动智能终端比较少，这四个目录要根据CPU的架构来选，而市面上ARM架构的手机占大多数，所以一般的APK只包含ARM和ARM-V7a的so。
res目录：res是resource的缩写，这个目录存放资源文件，存在这个文件夹下的所有文件都会映射到Android工程的.R文件中，生成对应的ID，访问的时候直接使用资源ID即R.id.filename，res文件夹下可以包含多个文件夹。
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文件名 |
存储内容 |
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anim |
存放动画文件； |
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drawable |
目录存放图像资源； |
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layout |
目录存放布局文件； |
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values |
目录存放一些特征值； |
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colors.xml |
存放color颜色值； |
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dimens.xml |
定义尺寸值； |
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string.xml |
定义字符串的值； |
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styles.xml |
定义样式对象； |
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xml |
文件夹存放任意xml文件，在运行时可以通过Resources.getXML()读取； |
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raw |
是可以直接复制到设备中的任意文件，他们无需编译。 |
AndroidManifest.xml：是Android应用程序的配置文件，是一个用来描述Android应用“整体资讯”的设定文件， Android系统可以根据这个“自我介绍”完整地了解APK应用程序的资讯，每个Android应用程序都必须包含一个AndroidManifest.xml文件，且它的名字是固定的，不能修改。我们在开发Android应用程序的时候，一般都把代码中的每一个Activity，Service，Provider和Receiver在AndroidManifest.xml中注册，只有这样系统才能启动对应的组件，另外这个文件还包含一些权限声明以及使用的SDK版本信息等等。程序打包时，会把AndroidManifest.xml进行简单的编译，便于Android系统识别，编译之后的格式是AXML格式，如下图1所示：
图1 AXML格式
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axml头 |
其中的axml头是固定标识axml文件的，其值固定时0x00080003。 |
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axml文件长度 |
标识axml文件的大小。 |
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StringDataSegment |
xml文件中所有字符串类型保存在此。 |
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ResourceIdSegment |
xml文件中声明的资源文件ID保存于此。 |
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XmlContentSegment |
是xml的内容段，按照xml文件中的结构依次排开，保存xml的数据内容。 |
classes.dex：
传统的Java程序，首先先把Java文件编译成class文件，字节码都保存在了class文件中，Java虚拟机可以通过解释执行这些class文件。而Dalvik虚拟机是在Java虚拟机进行了优化，执行的是Dalvik字节码，而这些Dalvik字节码是由Java字节码转换而来，一般情况下，Android应用在打包时通过AndroidSDK中的dx工具将Java字节码转换为Dalvik字节码。dx工具可以对多个class文件进行合并，重组，优化，可以达到减小体积，缩短运行时间的目的。dx工具的转换过程如图2所示：
图2 dx工具把.class文件转换成dex文件
dx工具把每个.class文件的每个区域的内容进行去重，重组，优化重排后生成dex文件，生成的dex文件可以在Dalvik虚拟机执行，且速度比较快。
resources.arsc：用来记录资源文件和资源ID之间的映射关系，用来根据资源ID寻找资源。Android的开发是分模块的，res目录专门用来存放资源文件，当在代码中需要调用资源文件时，只需要调用findviewbyId()就可以得到资源文件，每当在res文件夹下放一个文件，aapt就会自动生成对应的ID保存在.R文件，我们调用这个ID就可以，但是只有这个ID还不够，.R文件只是保证编译程序不报错，实际上在程序运行时，系统要根据ID去寻找对应的资源路径，而resources.arsc文件就是用来记录这些ID和资源文件位置对应关系的文件。