二者有两个大的区别：
1：unix系统大多是与硬件配套的，也就是说，大多unix系统无法安装在x86服务器和个人计算机上，而liunx系统可以运行在多种硬件平台上。
2：unix是商业软件，而linux是开源软件，是免费，公开源代码的。
经过多年的发展，linux已成为nuix最优秀的传承者。
Unix/linux系统结构
两系统可以抽象为3层，底层是linux/nuix操作系统，即为系统内核
中间层是Shell层，即为命令解释层
高层是应用层
A：内核层
内核层是unix/linux系统的核心和基础，它直接附着在硬件平台上，控制和管理系统内各种资源（硬件资源和软件资源），有效的组织进程的运行，从而扩展硬件的功能，提高资源利用率，为用户提供方便，高效，安全，可靠的应用环境。
B：shell层
Shell层是与用户直接交互的界面，用户可以在命令提示符下输入命令，由shell解释执行并输出相应结果或者有关信息，所以我们也把shell称作命令解释器，利用系统提供的丰富命令可以快捷而简便的完成许多工作。
C：应用层
应用层提供基于xwindow协议的图形环境，xwindow系统定义了一个系统所必须具备的功能（就如同TCP/IP是一个协议，定义软件所应具备的功能），使系统能够满足此协议及符合X协会其他的规范，便可称为x window
Xwindow与微软的windows图形环境有很大区别：
Unix/linux系统与X window没有必然捆绑的关系，也就是说，linux可以安装x window，也可以不安装；而微软的windows图形环境与内核捆绑密切。
Unix/linux系统不依赖于图形环境，依然可以通过命令行完成百分之百的功能，而且因为不使用图形环境还会节省大量的系统资源。