用的是ubuntu系统，一直在普通用户模式下打开Git下建的项目，今天运行神经网络程序时，由于有一个cudnn错误，必须要在sudo模式下才不会报错，所以用sudo试着打开了pycharm，发现是完全另一个pycharm，原先界面设置都没有了，发现在root模式和普通模式下pycharm的配置不一样，应该是有两个配置文件，一个属于普通用户模式，一个属于root模式。然后我就切换回普通模式，发现那个项目无法被编译了，一关闭或者更改代码不能save，关闭时也各种提醒，什么以下两个文件时只读文件，workspace.xml和还有一个文件。在网上找到一个方法解决了，记录一下。
这是因为你在两种不同的权限下进行了来两次编译，所以会有冲突的文件，这时在pycharm中操作很麻烦，所以只需要打开命令行，执行下面的一句话就OK了：
sudo chown -R $USER /projectdirectory(这里就写你项目的目录)
比如我的是把我所有项目文件都填进去
sudo chown -R $USER ~/Git
然后到pycharm中重新编译一下，就能完美解决问题了。