ubuntu R 3.4
安装R
$sudo apt-get update $sudo apt-get install r-base $sudo apt-get install r-base-dev
安装一些可能的依赖包
$sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/imagemagick $sudo apt-get update $sudo apt-get install -y libmagick++-dev $sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
安装一些R包
$R # 进入R >source("https://bioconductor.org/biocLite.R"); >biocLite("GenomicRanges"); >install.packages("ggplot2"); >install.packages("data.table"); >install.packages("egg"); >install.packages("magrittr"); >install.packages("parallel"); >install.packages("multipanelfigure");
Windows R 3.6
直接官网下载安装即可。
当 R 版本在 3.6 及以上时，使用 BiocManager 安装 Bioconductor 中的包
https://bioconductor.org/install/
>install.packages("BiocManager") >BiocManager::install("GenomicRanges") >install.packages("ggplot2", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
>install.packages("data.table", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
>install.packages("egg", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
>install.packages("magrittr", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
>install.packages("parallel", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
>install.packages("multipanelfigure", repository = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")