【UVa】760 DNA Sequencing

#include<cstdio>
#include<cstring>
#define MAXN 660
char s[MAXN];
int wa[MAXN],wb[MAXN],wv[MAXN],ws[MAXN];
int sa[MAXN],height[MAXN],rk[MAXN];
inline bool cmp(int *r,int a,int b,int L)
{
    return r[a]==r[b]&&r[a+L]==r[b+L];
}
void SA(int n,int m)
{
    int i,j,p,*x=wa,*y=wb,*t;
    for(i=0;i<m;i++)
        ws[i]=0;
    for(i=0;i<n;i++)
        ws[x[i]=s[i]]++;
    for(i=1;i<m;i++)
        ws[i]+=ws[i-1];
    for(i=n-1;i>=0;i--)
        sa[--ws[x[i]]]=i;
    for(j=p=1;p<n;j<<=1,m=p)
    {
        for(p=0,i=n-j;i<n;i++)
            y[p++]=i;
        for(i=0;i<n;i++)
        {
            if(sa[i]>=j)
                y[p++]=sa[i]-j;
        }
        for(i=0;i<m;i++)
            ws[i]=0;
        for(i=0;i<n;i++)
            ws[wv[i]=x[y[i]]]++;
        for(i=1;i<m;i++)
            ws[i]+=ws[i-1];
        for(i=n-1;i>=0;i--)
            sa[--ws[wv[i]]]=y[i];
        for(t=x,x=y,y=t,x[sa[0]]=0,p=i=1;i<n;i++)
            x[sa[i]]=cmp(y,sa[i-1],sa[i],j)?p-1:p++;
    }
}
void Height(int n)
{
    int i,j,k;
    for(i=1;i<=n;i++)
        rk[sa[i]]=i;
    for(i=k=0;i<n;height[rk[i++]]=k)
        for(k?k--:0,j=sa[rk[i]-1];s[i+k]==s[j+k];k++);
}
bool OK(int n,int len,int mid)
{
    int i,j;
    for(i=1;i<=n;i++)
    {
        if(height[i]>=mid)
        {
            for(j=i;j<=n&&height[j]>=mid;j++)
            {
                if(sa[j-1]<len&&sa[j]>len||sa[j-1]>len&&sa[j]<len)
                    return true;
            }
            i=j-1;
        }
    }
    return false;
}
int main()
{
    int n,len,low,high,mid,i,j,k;
    bool first=true;
    while(~scanf(" %s",s))
    {
        if(first)
            first=false;
        else
            putchar('\n');
        len=strlen(s);
        s[len]='#';
        scanf(" %s",s+len+1);
        n=strlen(s);
        SA(n+1,'z'+1);
        Height(n);
        for(low=0,high=n;low<high;)
        {
            mid=(low+high)>>1;
            if(OK(n,len,mid))
                low=mid+1;
            else
                high=mid;
        }
        low--;
        if(low)
        {
            for(i=1;i<=n;i++)
            {
                if(height[i]>=low)
                {
                    for(j=i;j<=n&&height[j]>=low;j++);
                    for(k=i;k<j;k++)
                    {
                        if(sa[k-1]<len&&sa[k]>len||sa[k-1]>len&&sa[k]<len)
                            break;
                    }
                    if(k!=j)
                    {
                        for(k=sa[i];k<sa[i]+low;k++)
                            putchar(s[k]);
                        putchar('\n');
                    }
                    i=j-1;
                }
            }
        }
        else
            puts("No common sequence.");
    }
    return 0;
}