一、参数文件
Mysql实例启动时，数据库会读取配置参数文件，用来寻找数据库各种文件所在位置以及指定某些初始化参数
1、什么是参数
简单来说，数据库参数可以看成一个键值对，可以通过命令Show Variables查看数据库中的所有参数
2、参数类型
Mysql数据库中的参数分为两类：动态参数和静态参数。动态参数意味着可以再Mysql实例运行中进行修改，静态参数指再整个实例生命周期内都不能更改。动态参数可以通过Set命令进行修改，可以指定global和session关键字，分别代表是整个实例的生命周期还是基于当前会话，对变量的全局值修改后仅在当前生命周期内有效，若想永久生效需要修改参数文件。
二、日志文件
日志文件记录了影响Mysql数据库的各种类型活动，常见的日志文件有错误日志、二进制日志、慢查询日志和查询日志
1、错误日志
错误日志文件对MySql的启动、运行、关闭过程进行了记录，用户可以适用Show Variables Like 'log_error'来定位该文件，当数据库不能重启时，第一个查找的文件就应该是错误日志文件
2、慢查询日志
Mysql启动时可以设置一个阈值，所有运行时间超过该阈值的SQL语句都可以记录到慢查询日志文件中，阈值可以通过参数long_query_time进行设置，默认值为10代表10秒。默认情况下Mysql不启动慢查询日志，需要手动开启。
long_queries_not_using_indexes参数指查询语句没有使用索引，Mysql同样会将其记录到慢查询日志中，该参数需要手动开启。log_throttle_queries_not_using_indexes参数表示每分钟允许记录到慢查询日志且未使用索引的SQL语句的次数，默认为0表示没有限制。
随着越来越多的查询被记录到了慢查询日志文件中，分析就会变得复杂，这时可以使用mysqldumpslow命令进行查看。从5.1版本开始可以查看mysql架构下的slow_log表（通过设定log_output为Table）
3、查询日志
查询日志记录了所有对MySQL数据库请求的信息，无论请求是否得到了正确的执行，默认文件名为主机名.log，可以使用tail 文件名进行查看。从5.1版本开始，可以将查询日志的记录放入mysql架构下的general_log表中
4、二进制日志
二进制日志记录了对Mysql数据库执行更改的所有操作，不包括Select和Show操作，若操作没有导致数据库的变化，该操作可能也会写入二进制日志。二进制日志主要有数据恢复、复制（实时同步）、审计（判断是否有注入攻击）等功能。通过配置参数log-bin[=name]可以启动二进制日志，若不指定会使用主机名，后缀名为二进制日志的序列号。查看二进制文件可以使用Mysql提供的mysqlbinlog工具
使用以下配置文件会影响二进制日志记录的信息和行为：
- max_binlog_size：制定了单个二进制日志文件的最大值，超过该值则产生新的二进制日志文件，后缀名+1，并记录到.index文件，默认值为1.0G
- binlog_cache_size：当一个线程开启一个事务时，Mysql会分配一个大小为该值的缓存来记录二进制日志，当事务的记录大小超过该值，Mysql会将缓冲中的日志写入一个临时文件中。可以使用binlog_cache_use和binlog_cache_disk_use的状态来判断该值是否合适
- sync_binlog：该值表示每写缓冲多少次就同步到磁盘，为1时表示采取同步的方式写入磁盘不使用，其默认值为0，表示MySQL不控制binlog的刷新，由文件系统自己控制它的缓存的刷新，这样设置性能最佳但是风险最大
- binlog-do-db和binlog-ignore-db：表示需要写入或忽略写入哪些库的日志，默认为空表示需要同步所有库的日志到二进制日志
- binlog_format：会影响记录二进制日志的格式。设置为Statement时记录的是日志的逻辑SQL语句，设置为Row时记录的是行更改情况，设置为MIXED格式表示Mysql默认使用Statement格式但在一些情况下使用Row格式。通常情况下将其设置为Row，但是对磁盘的占用会较大。
三、表结构定义文件
Mysql数据的存储是根据表进行的，每个表都有与之对应的文件，其后缀为frm，记录了表结构定义
四、InnoDB存储引擎文件
1、表空间文件
InnoDB采用将存储的数据按表空间进行存放的设计，默认配置下会有一个初始大小为10M名为ibdata1的默认表空间文件，用户可以通过参数innodb_data_file_path对其进行设置，设置后所有基于InnoDB存储引擎的表的数据都会记录到该共享表空间中，若设置了参数innodb_file_per_table为ON，则用户可以将每个基于InnoDB存储引擎的表产生一个独立表空间，独立表空间的命名规则为：表名.idb
2、重做日志文件
默认情况下，InnoDB存储引擎的数据目录下会有名为ib_logfile0和ib_logfile1的文件，它们是存储引擎的重做日志文件，它们记录了对于InnoDB存储引擎的事务日志，当因断电导致的实例失败时，就可以使用重做日志文件了。
每个InnoDB存储引擎至少有1个重做日志文件组，每个文件组下至少有两个重做日志文件，为了得到更高的可靠性可以设置多个的镜像日志组，将不同的文件组放在不同的磁盘上，以提高重做日志的高可用性。日志组中的每个重做日志文件大小一致，并且回以循环写入的方式运行
下述属性会影响重做日志的属性：
- innodb_log_file_size：指定重做日志文件的大小，1.2.x版本后该限制为512G
- innodb_log_files_in_group：指定日志文件组中国重做日志文件的数量，默认为2
- innodb_mirrored_log_groups：指定日志镜像文件组的数量，默认为1
- innodb_log_group_home_dir：指定文件组所在的路径，默认为./，表示再数据库的数据目录下
二进制日志文件记录的是所有与MySQL数据库有关的日志记录，而重做日志文件只记录了存储引擎有关的事务日志，且记录的是每个页的更改的物理情况，而非具体的操作内容
主线程中每秒会将重做日志缓冲写入磁盘的重做日志文件中，不论事务是否已经提交，另一个触发写磁盘的过程由innodb_flush_log_at_txr_commit控制，表示在提交操作时，处理重做日志的方式。0表示不讲事务的重做日志写入磁盘上的日志文件，1表示在执行commit时将重做日志缓冲同步写到磁盘，2表示将重做日志异步写道磁盘，即写到文件系统的缓存中，通常为了保证ACID原则中的持久性，必须将innodb_flush_log_at_txr_commit参数设置为1