<%@ include file="" %>是将文件原封不动的copy进现有的文件中，像是拼接好后，再编译成为servlet运行。
<jsp:include page=""></jsp:include>是编译后的servlet运行到该句时，跳转到指定的jsp编译的那个servlet继续运行，然后将运行结果，copy到现在的jsp中，故包含与被包含文件都是单独运行的。
在开发过程中，我们需要正确选择使用。举个例子：
比如在工程项目中，每个jsp文件需要引入包含公共js和css文件信息的jsp文件，由于相对路径的问题的存在，我们需要在head标签中添加<base href="<%=basePath%>">，而此时，在<%@ include file="" %>时便会报错。
详见：http://www.cnblogs.com/brolanda/p/4143905.html