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  • 【原】Spark之机器学习(Python版)(一)——聚类

        kmeans聚类相信大家都已经很熟悉了。在Python里我们用kmeans通常调用Sklearn包(当然自己写也很简单)。那么在Spark里能不能也直接使用sklean包呢?目前来说直接使用有点困难,不过我看到spark-packages里已经有了,但还没有发布。不过没关系,PySpark里有ml包,除了ml包,还可以使用MLlib,这个在后期会写,也很方便。

      首先来看一下Spark自带的例子

     1 from pyspark.mllib.linalg import Vectors
     2 from pyspark.ml.clustering import KMeans
     3 from pyspark.sql import SQLContext
     4 from pyspark.mllib.linalg import Vectors
     5 #导入数据
     6 data = [(Vectors.dense([0.0, 0.0]),), (Vectors.dense([1.0, 1.0]),),(Vectors.dense([9.0, 8.0]),), (Vectors.dense([8.0, 9.0]),)]
     7 df = sqlContext.createDataFrame(data, ["features"])
     8 #kmeans模型
     9 kmeans = KMeans(k=2, seed=1)
    10 model = kmeans.fit(df)
    11 #簇心数量
    12 centers = model.clusterCenters()
    13 len(centers)
    14 #2
    15 #训练模型
    16 transformed = model.transform(df).select("features", "prediction")
    17 rows = transformed.collect()
    18 rows[0].prediction == rows[1].prediction
    19 #True
    20 rows[2].prediction == rows[3].prediction
    21 # True

      这个例子很简单,导入的数据是四个稠密向量(可以自己在二维向量里画一下),设定了两个簇心,最后验证预测的结果是否正确,显示为True,证明预测正确。算法中具体的参数可以参考API中的说明。然而实际生产中我们的数据集不可能以这样的方式一条条写进去,一般是读取文件,关于怎么读取文件,可以具体看我的这篇博文。这里我们采用iris数据集(不要问我为什么又是iris数据集,因为真的太方便了)来给大家讲解一下。

      

      我的数据集是csv格式的,而Spark又不能直接读取csv格式的数据,这里我们有两个方式,一是我提到的这篇博文里有写怎么读取csv文件,二是安装spark-csv包(在这里下载),github地址在这里。按照步骤安装可以了。这里友情提示一下大家,github的安装方法是:

    $SPARK_HOME/bin/spark-shell --packages com.databricks:spark-csv_2.11:1.4.0

      

      如果报错了,可以把 --packages 换成 --jars,如果还是不行,在加一个 common-csv.jars包放到lib下面就可以了。我因为这个耽误了不少时间,不过具体问题也得具体分析。

      安装好这个包以后,就可以读取数据了

      

    1 from pyspark.sql import SQLContext
    2 sqlContext = SQLContext(sc)
    3 data = sqlContext.read.format('com.databricks.spark.csv').options(header='true', inferschema='true').load('iris.csv')
    4 data.show()

      

      读取数据以后,我们来看一下数据集:

      

     1 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+
     2 |row.id|Sepal.Length|Sepal.Width|Petal.Length|Petal.Width|Species|
     3 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+
     4 |     1|         5.1|        3.5|         1.4|        0.2|      0|
     5 |     2|         4.9|        3.0|         1.4|        0.2|      0|
     6 |     3|         4.7|        3.2|         1.3|        0.2|      0|
     7 |     4|         4.6|        3.1|         1.5|        0.2|      0|
     8 |     5|         5.0|        3.6|         1.4|        0.2|      0|
     9 |     6|         5.4|        3.9|         1.7|        0.4|      0|
    10 |     7|         4.6|        3.4|         1.4|        0.3|      0|
    11 |     8|         5.0|        3.4|         1.5|        0.2|      0|
    12 |     9|         4.4|        2.9|         1.4|        0.2|      0|
    13 |    10|         4.9|        3.1|         1.5|        0.1|      0|
    14 |    11|         5.4|        3.7|         1.5|        0.2|      0|
    15 |    12|         4.8|        3.4|         1.6|        0.2|      0|
    16 |    13|         4.8|        3.0|         1.4|        0.1|      0|
    17 |    14|         4.3|        3.0|         1.1|        0.1|      0|
    18 |    15|         5.8|        4.0|         1.2|        0.2|      0|
    19 |    16|         5.7|        4.4|         1.5|        0.4|      0|
    20 |    17|         5.4|        3.9|         1.3|        0.4|      0|
    21 |    18|         5.1|        3.5|         1.4|        0.3|      0|
    22 |    19|         5.7|        3.8|         1.7|        0.3|      0|
    23 |    20|         5.1|        3.8|         1.5|        0.3|      0|
    24 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+
    25 only showing top 20 rows

      

      第二步:提取特征

      我们在上一步导入的数据中label是String类型的,但在Spark中要变成数值型才能计算,不然就会报错。可以利用StringIndexer功能将字符串转化为数值型

    1 from pyspark.ml.feature import StringIndexer
    2 
    3 feature = StringIndexer(inputCol="Species", outputCol="targetlabel")
    4 target = feature.fit(data).transform(data)
    5 target.show()

      targetlabel这一列就是Species转化成数值型的结果

     1 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+-----------+
     2 |row.id|Sepal.Length|Sepal.Width|Petal.Length|Petal.Width|Species|targetlabel|
     3 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+-----------+
     4 |     1|         5.1|        3.5|         1.4|        0.2|      0|        0.0|
     5 |     2|         4.9|        3.0|         1.4|        0.2|      0|        0.0|
     6 |     3|         4.7|        3.2|         1.3|        0.2|      0|        0.0|
     7 |     4|         4.6|        3.1|         1.5|        0.2|      0|        0.0|
     8 |     5|         5.0|        3.6|         1.4|        0.2|      0|        0.0|
     9 |     6|         5.4|        3.9|         1.7|        0.4|      0|        0.0|
    10 |     7|         4.6|        3.4|         1.4|        0.3|      0|        0.0|
    11 |     8|         5.0|        3.4|         1.5|        0.2|      0|        0.0|
    12 |     9|         4.4|        2.9|         1.4|        0.2|      0|        0.0|
    13 |    10|         4.9|        3.1|         1.5|        0.1|      0|        0.0|
    14 |    11|         5.4|        3.7|         1.5|        0.2|      0|        0.0|
    15 |    12|         4.8|        3.4|         1.6|        0.2|      0|        0.0|
    16 |    13|         4.8|        3.0|         1.4|        0.1|      0|        0.0|
    17 |    14|         4.3|        3.0|         1.1|        0.1|      0|        0.0|
    18 |    15|         5.8|        4.0|         1.2|        0.2|      0|        0.0|
    19 |    16|         5.7|        4.4|         1.5|        0.4|      0|        0.0|
    20 |    17|         5.4|        3.9|         1.3|        0.4|      0|        0.0|
    21 |    18|         5.1|        3.5|         1.4|        0.3|      0|        0.0|
    22 |    19|         5.7|        3.8|         1.7|        0.3|      0|        0.0|
    23 |    20|         5.1|        3.8|         1.5|        0.3|      0|        0.0|
    24 +------+------------+-----------+------------+-----------+-------+-----------+
    25 only showing top 20 rows

      

      最后一步:模型训练和验证

     1 from pyspark.sql import Row
     2 from pyspark.ml.clustering import KMeans
     3 from pyspark.mllib.linalg import Vectors
     4  
     5 #把数据格式转化成稠密向量
     6 def transData(row):
     7     return Row(label=row["targetlabel"],
     8                features=Vectors.dense([row["Sepal.Length"],
     9                    row["Sepal.Width"],
    10                    row["Petal.Length"],
    11                    row["Petal.Width"]]))
    12  
    13 #转化成Dataframe格式
    14 transformed = target.map(transData).toDF()
    15 kmeans = KMeans(k=3)
    16 model = kmeans.fit(transformed) 
    17 
    18 predict_data = model.transform(transformed)
    19 
    20 train_err = predict_data.filter(predict_data['label'] != predict_data['prediction']).count() 
    21 total = predict_data.count()
    22 print traing_err, total, float(train_err)/total

      到这一步就结束了。总结一下,用pyspark做机器学习时,数据格式要转成需要的格式,不然很容易出错。下周写pyspark在机器学习中如何做分类。

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