步骤一：先运行MathType，点击“Size”菜单中的“Define”命令，中文版的“尺寸”——“定义”。
点击“Size”——“Define”
步骤二：打开“Define Sizes”对话框，我们可以在“Full”后的输入框中要调整的字号大小(比如word字体为小五，则相应的公式大小调整为9 pt)。公式中其它的元素会自动进行相应的调整的，所以一般情况下可以不做其它改动。点击“OK”按钮，关闭对话框。在打开的“定义尺寸”对话框，可以在“完全”后面输入要调整的字号大小，单击“确定”。
Define Sizes对话框
步骤三：Word2003字体大小与Mathtype6.0字PT对照表，字体大小对照表如下。
字体大小对照表
步骤四：再点击“Preferences”菜单中的“Equation Preferences→Save to File”命令，将我们设置好的选项保存成一个后缀名为“eqp”的文件。点击主界面菜单的“参数”——“公式参数”——“保存到文件”命令，把刚才的设置保存为一个“.eqp”格式的文件。（在MathType的安装目录下../mathtype/preferences/文件.eqp）。
点击“Preferences”菜单中的“Equation Preferences→Save to File”
步骤五：这就是保存格式，后面我们还要在WORD中打开，这就是是调整公式大小的关键文件）。
保存界面
步骤六：然后回到Word环境中，点击“MathType”菜单中的“Format Equations”命令（可能很多朋友遇到菜单栏没能显示mathtype选项，解决办法见后面）。
点击MathType——Format Equations
步骤七：打开Format Equations对话框。
Format Equations对话框
步骤八： 然后在打开的“Format Equations”对话框中选中中间的“MathType preference file”单选项，并点击“Browse”按钮，找到我们保存好的那个text.eqp文件并双击。然后再选中下方“Range”项目中“Whole document”单选项，点击“OK”按钮后稍候片刻，就可以看到所有的公式都按指定的字号调整完成了。
点击Browse找到对应文件
步骤九：下图为调整后的效果。
References ：
1.http://www.mathtype.cn/jiqiao/piliang-tiaozheng.html