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(1) Mental Link 项目
Mental Link 是一种映射工具把一个对象转化成本体实例，这个框架简化了对象翻译过程，在一个以本体为基础的系统中，或者基于本体规则的推理过程。
(2) Ontolgoy-base Ethology Tools
这个项目的目的是开发一种研究动物行为的本体为基础的工具。项目目的是不是产生一个通用的本体或者编辑器，而是Comparative metiods and data entry tools
(3) JOFS (Java Ontology for File Storage) (JOFS本体Java 用来文件存储)http://sourceforge.net/projects/jofs/
JOFS 是一个java工程，该工程用来开发一个OWL本体，用这个本体来存储文件或文档的元信息。他提供了管理本体的核心代码和一个用来增加核心功能的架构。
(4) MAFRT Toolkit
本体映射框架工具箱，用来语义关系关于两个本体之间（原本体和目标本体），提供了一种把原本体实例映射为目标本体实例的过程
(5) Large commonsense ontology
这个工程的目的是建立一个非常大的本体。这个工程将要建立100本体
(6) EFO
试验因素本体是一个集中本体建模工具的应用程序
(7) ORE(本体规则编辑器)
ORE是一个独立平台的应程序，主要是用来广利接口规则。ORE提供了一个简单友好的界面和直接的GUI来定义和测试本体接口规则。
(8) MSI-Ontology
(9) Cell Cycle Ontology
该项目扩展了现有的cell本体
(10) OBrowse
是一个本体的网络浏览器，采用JAVA开发的。以树状的形式显示OWLB本体，采用了Protégé-API，JSF等技术用来开发
(11) KAON Ontology Framework
KAON
(12) WikiOnt
是一个以Wiki为基础的本体编辑和浏览器，采用java写成。本体能够导入或者导出为OWL文件
(13) GOAL(Gene Ontology Annotative Listing)
开源的php应用程序用来可视化和手机生物序列，以本体结构
(14) COB Edit
(15) Comparative data analysis Ontolgy
研究和开发本体用来分析和表达数据，在进化分析中.
(16) Ontolgoy Based Tagging
这个java工程创建一个册书皇家用来分析图像特定
(17) Music Ontology
语义网爬行器
(18) Web2OWL
这是一个本体编辑器用来序列化OWL本体通过Web浏览器。
(19) Sequence Ontolgy
(20) Ontology Design Pattterns
(21) Ontologyjam
Ontology jam 是一个创建本体工具，通过他做些实体研究