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  • GenBank序列名称解析

    1. 分子生物学的中心法则是DNA转录成RNA然后翻译成蛋白质。

    2. GenBank序列名称解析

    格式:LOCUS       EU740255    728 bp              DNA  linear      VRT                    15-JUL-2008
                             locus name   sequence lenght molecule type  GenBank division  modification date 

    索引号码(locus name):
    GenBank/EMBL/DDBJ核酸序列记录  一个字母跟着5个数字,如X02775
                                                     两个字母跟着6个数字,如AF025334
    RefSeq核酸序列记录                      两个字母,一个下划线,6个数字。如mRNA记录(NM_*);基因组DNA片段记录(NT_*)

    数据文件类型:
    1. PRI:灵长类(primate)
    2. ROD: 啮齿类(rodent)
    3. MAM: 其他哺乳类(mammalian)
    4. VRT: 其他脊椎动物(vertebrate)
    5. INV:非脊椎动物(invertebrate)
    6. PLN: 植物、真菌和藻类
    7. BCT: 细菌(bacterial)
    8. VRL: 病毒(viral)
    9. PHG: 噬菌体(bacteriophage)
    10.SYN: 人工合成(synthetic)
    11.UNA: 未经注释(unannotated)
    12.EST: EST(expressed sequence tags,表达序列标签)
    13.PAT: 专利( patent)
    14.STS:STS(sequence-tagged sites,序列标签位点)
    15.GSS:GSS(genome survey sequences,基因组测序序列)
    16.HTG:HTGS(high-throughput genomic sequences,高通量基因组序列)

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/frostbelt/p/1868682.html
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