freesurfer:
freesurfer好安装,只需要下载官网源码包,如freesurfer5.3.tar.gz
下载至本地,解压:
tar zxvf freesurfer5.3.tar.gz -C /software/freesurfer5.3
其中,-C选项能够设置解压路径
然后只需要在本地用户的.bashrc下设置freesurfer变量即可:
gedit ~/.bashrc:
export FREESURFER_HOME=/software/freesurfer5.3
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
export PATH=/software/freesurfer5.3/bin:$PATH
fsl:
ubuntu下安装见官网
Centos系统下安装过程:
网络正常时,直接运行fslinstaller.py文件:
./fslinstaller.py或者Python fslinstaller.py
网络不好时,需要在一台网络好的机器上下载源码包:(我就遇到过这种情况)
./fslinstaller.py -o
安装好后,在.bashrc下添加:
export PATH=/mnt/sys/Programs/fsl/bin:$PATH
export FSLDIR=/mnt/sys/Programs/fsl
source $FSLDIR/etc/fslconf/fsl.sh
matlab:
安装包里有安装脚本,运行即可,然后按照下载里面的激活步骤进行激活。
运行时,可能会出现libXpm.so.6等相关依赖库缺失,这时,就需要手动安装,或yum install libXpm*等相关命令。