zoukankan      html  css  js  c++  java
  • 数理统计(一)——用Python进行方差分析


      iwehdio的博客园:https://www.cnblogs.com/iwehdio/

      方差分析可以用来推断一个或多个因素在其状态变化时,其因素水平或交互作用是否会对实验指标产生显著影响。主要分为单因素方差分析、多因素无重复方差分析和多因素重复方差分析。
      做数理统计课后题,发现方差分析计算比较麻烦,想用Python掉包实现。但是发现大多教程对参数的讲解不是很清楚,在此做记录。
      主要用到的库是pandas和statsmodels。简要流程是,先用pandas库的DataFrame数据结构来构造输入数据格式。然后用statsmodels库中的ols函数得到最小二乘线性回归模型。最后用statsmodels库中的anova_lm函数进行方差分析。

    import pandas as pd
    import numpy as np
    from statsmodels.formula.api import ols
    from statsmodels.stats.anova import anova_lm
    

    ​   首先,是输入的数据格式。使用pandas的DataFrame,每一行为一次试验的因素水平和试验结果。以下图中的题目为例。

      则对于因素A和因素B即结果R可表示为如下的DataFrame:

    data = pd.DataFrame([[1, 1, 32],
                         [1, 2, 35],
                         [1, 3, 35.5],
                         [1, 4, 38.5],
                         [2, 1, 33.5],
                         [2, 2, 36.5],
                         [2, 3, 38],
                         [2, 4, 39.5],
                         [3, 1, 36],
                         [3, 2, 37.5],
                         [3, 3, 39.5],
                         [3, 4, 43]], 
                        columns=['A', 'B', 'value'])
    

    ​   第一列为因素A的水平,第二列为因素B的水平,第三列为试验结果。在方差分析中,只关心每次试验中因素水平是否相同,所以我们可以把较为复杂的因素水平抽象为标签值 1,2,3。  

    ​   然后,输入ols函数。主要用到该函数的两个参数,formula和data。
      formula指定了:
            ①试验结果是哪一列。
            ②需要计算的是哪几个因素水平对结果的影响。
            ③是否计算交互作用。

      formula的类型为字符串,输入格式为如果试验结果的列名为‘value’,需要计算的因素的列名为‘A’和‘B’,则示例如下。

    # 因素A的水平对结果的影响
    'value ~ C(A)'
    
    # 因素A和因素B的水平对结果的影响
    'value ~ C(A) + C(B)'
    
    # 因素A和因素B以及A和B的交互作用的水平对结果的影响
    'value ~ C(A) + C(B) + C(A)*C(B)'
    
    # 多因素无重复试验,不计算交互作用的影响
    model = ols('value~C(A) + C(B)', data=data[['A', 'B', 'value']]).fit()
    anovat = anova_lm(model)
    print(anovat)
    

      data为之前生成的DataFrame中选出的进行分析所需要的列,实际上ols是通过DataFrame的列名来获得试验结果和因素水平的数据的。
      最后用ols函数进行最小二乘线性拟合,用anova_lm函数进行方差分析并输出结果。之前题目输出的结果为:

      Residual表示误差,df表示自由度,sum_sq表示离差平方和,mean_sq表示均方离差,F表示F值,PR(>F)表示F值所对应的显著水平α。
      进行单因素多方差分析,将formula中的C(B)去掉即可。如果是对于有重复的多因素方差分析,示例如下:

      结果为: 

    参考:施雨 《应用数理统计(西安交通大学)》 课后习题 4.1,4.3,4.5,4.6,4.9
       python做单因素方差分析:https://www.cnblogs.com/jin-liang/p/9852321.html
       Python数据科学:方差分析:https://blog.csdn.net/Kaitiren/article/details/85066793

    iwehdio的博客园:https://www.cnblogs.com/iwehdio/

  • 相关阅读:
    运算符
    JS的基本概念和数据类型
    开源基于Canal的开源增量数据订阅&消费中间件
    用AntDeploy如何更新Agent
    AntDeploy发布前端项目到IIS(脱离vs单独使用)
    截图上传录屏gif上传工具推荐
    netcore开发windows普通服务(非Web)并一键发布到服务器
    一键发布部署vs插件[AntDeploy]开源了
    基于python的Elasticsearch索引的建立和数据的上传
    浅谈闭包
  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/iwehdio/p/12019725.html
Copyright © 2011-2022 走看看