转自：http://www.csdn.net/article/2013-03-25/2814634-data-de-duplication-tactics-with-hdfs
摘要：随着收集到数据体积的激增，去重无疑成为众多大数据玩家面对的问题之一。重复数据删除在减少存储、降低网络带宽方面有着显著的优势，并对扩展性有所帮助。在存储架构中，删除重复数据的常用方法包括哈希、二进制比较和增量差分；而本文专注的是使用MapReduce和HDFS对数据进行去重。
随着存储数据信息量的飞速增长，越来越多的人开始关注存储数据的缩减方法。数据压缩、单实例存储和重复数据删除等都是经常使用的存储数据缩减技术。
重复数据删除往往是指消除冗余子文件。不同于压缩，重复数据删除对于数据本身并没有改变，只是消除了相同的数据占用的存储容量。重复数据删除在减少存储、降低网络带宽方面有着显著的优势，并对扩展性有所帮助。
举个简单的例子：在专门为电信运营商定制的呼叫详单去重应用程序中，我们就可以看到删除重复数据的影子。同样的，对于包含相同数据包的通信网络，我们可以使用这种技术来进行优化。
在存储架构中，删除重复数据的一些常用的方法包括：哈希、二进制比较和增量差分。在HadoopSphere这篇文章中，将专注于如何利用MapReduce和HDFS来消除重复的数据。（下面列出的方法中包括一些学者的实验方法，因此把术语定义为策略比较合适）。
策略1：只使用HDFS和MapReduce
Owen O’Malley在一个论坛的帖子中建议使用以下方法：
让你的历史数据按照MD5值进行排序。 运行一个MapReduce的作业，将你的新数据按照MD5进行排序。需要注意的是：你要做所有数据的整体排序，但因为MD5是在整个密钥空间中是均匀分布的，排序就变得很容易。
基本上，你挑选一个reduce作业的数量（如256），然后取MD5值的前N位数据来进行你的reduce作业。由于这项作业只处理你的新数据，这是非常快的。 接下来你需要进行一个map-side join，每一个合并的输入分块都包含一个MD5值的范围。RecordReader读取历史的和新的数据集，并将它们按照一定方式合并。（你可以使用map-side join库）。你的map将新数据和旧数据合并。这里仅仅是一个map作业，所以这也非常快。
当然，如果新的数据足够小，你可以在每一个map作业中将其读入，并且保持新记录（在RAM中做了排序）在合适的数量范围内，这样就可以在RAM中执行合并。这可以让你避免为新数据进行排序的步骤。类似于这种合并的优化，正是Pig和Hive中对开发人员隐藏的大量细节部分。
策略2：使用HDFS和Hbase
在一篇名为“ 工程云系统中一种新颖的删除重复数据技术”的论文中，Zhe Sun, Jun Shen, Jianming Young共同提出了一种使用HDFS和Hbase的方法，内容如下：
- 使用MD5和SHA-1哈希函数计算文件的哈希值，然后将值传递给Hbase
- 将新的哈希值与现有的值域比较，如果新值已经存在于Hbase去重复表中，HDFS会检查链接的数量，如果数量不为零时，哈希值对应的计数器将增加1。如果数量是零或哈希值在之前的去重复表中不存在，HDFS会要求客户端上传文件并更新文件的逻辑路径。
- HDFS将存储由用户上传的源文件，以及相应的链接文件，这些链接文件是自动生成的。链接文件中记录了源文件的哈希值和源文件的逻辑路径。
要注意使用这种方法中的一些关键点：
- 文件级的重复数据删除需要保持索引数量尽可能小，这样可以有高效的查找效率。
- MD5和SHA-1需要结合使用从而避免偶发性的碰撞。
策略3：使用HDFS，MapReduce和存储控制器
由Netapp的工程师AshishKathpal、GauravMakkar以及Mathew John三人联合，在一篇名为“ 在后期处理重复数据删除的分布式重复检测方式”的文章中，提出通过使用HadoopMapReduce的重复检测机制来替代Netapp原有的重复检测环节，文中提到的基于重复检测的Hadoop工作流包含如下几个环节：
- 将数据指纹（Fingerprint）由存储控制器迁移到HDFS
- 生成数据指纹数据库，并在HDFS上永久存储该数据库
- 使用MapReduce从数据指纹记录集中筛选出重复记录，并将去重复后的数据指纹表保存回存储控制器。
策略4：使用Streaming，HDFS，MapReduce
对于Hadoop和Streaming的应用集成，基本上包含两种可能的场景。以IBM Infosphere Streams和BigInsights集成为例，场景应该是：
1. Streams到Hadoop的流程：通过控制流程，将Hadoop MapReduce模块作为数据流分析的一部分，对于Streams的操作需要对更新的数据进行检查并去重，并可以验证MapReduce模型的正确性。
众所周知，在数据摄入的时候对数据进行去重复是最有效的，因此在Infosphere Streams中对于某个特定时间段或者数量的记录会进行去重复，或者识别出记录的增量部分。接着，经过去重的数据将会发送给Hadoop BigInsights用于新模型的建立。
2. Hadoop到Streams的流程：在这种方式中，Hadoop MapReduce用于移除历史数据中的重复数据，之后MapReduce模型将会更新。MapReduce模型作为Streams中的一部分被集成，针对mid-stream配置一个操作符（operator），从而对传入的数据进行处理。
策略5：结合块技术使用MapReduce
在莱比锡大学开发的一个原型工具Dedoop（Deduplication with Hadoop）中，MapReduce应用于大数据中的实体解析处理，到目前为止，这个工具囊括了MapReduce在重复数据删除技术中最为成熟的应用方式。
基于实体匹配的分块是指将输入数据按照类似的数据进行语义分块，并且对于相同块的实体进行限定。
实体解析处理分成两个MapReduce作业：分析作业主要用于统计记录出现频率，匹配作业用于处理负载均衡以及近似度计算。另外，匹配作业采用“贪婪模式”的负载均衡调控，也就是说匹配任务按照任务处理数据大小的降序排列，并做出最小负载的Reduce作业分配。
Dedoop还采用了有效的技术来避免多余的配对比较。它要求MR程序必须明确定义出哪个Reduce任务在处理哪个配对比较，这样就无需在多个节点上进行相同的配对比较。