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  • Meta

    通常我们所说的Meta有两种意思:

    第一种:收集已发表文献,然后做总结的Meta分析,又叫医学循证分析。参考:循证之路-meta分析入门培训

    第二种:宏基因组学Meta分析,我要说的就是这个。

    META类

    宏基因组学指以整体微生物群落基因组为研究对象的新研究方法。它通过直接在环境样品中提取微生物群体基因组的方法,为众多无法培养的微生物的研究及生物多样性研究开辟了一个新时代。宏基因组学在环境科学研究及生物标志物的研究中得到大量应用。华大基因提供宏基因组学解决方案包括:

    宏转录组调查

    宏基因组调查

    16S/18S/ITS扩增子测序(HiSeq 2000 / 454 FLX+ / MiSeq)

    马上要接受做微生物Meta分析,想想还是有点激动的。

    常识

    16S rRNA和16S rDNA有什么区别?
    16S rRNA和16S rDNA指的是同一种片段;rRNA是rDNA的转录产物;一般说的扩增是指扩增DNA。

    16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基,16SrDNA就是编码该亚基的基因。细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S rRNA。16S rDNA是细菌染色体上编码 rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中。
    16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟,其种类少,含量大(约占细菌RNA含量的80%),分子大小适中,存在于所有的生物中,其进化具有良好的时钟性质,在结构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石”之称。在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝,5S、16S、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。

    待续~

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