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    graphviz工具算法graphlayout数据结构

     

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    Graphviz介绍

    graphviz是贝尔实验室几个计算机牛人设计的一个开源 的图表(计算机科学中数据结构中的图)可视化项目,主要用C语言实现,主要实现了一些图布局算法。通过这些算法,可以将图中的节点在画布上比较均匀的分 布,缩短节点之间的边长,并且尽量的减少边的交叉。

    graphviz提供命令式的绘图方式,它提供一个dot语言 用来编写绘图脚本,然后对这个脚本进行解析,分析出其中的定点,边以及子图,然后根据属性进行绘制。具体的可以看一个例子,这个例子来自官方的文档。

    [c-sharp] view plaincopy
     
    1. digraph G {  
    2.     main -> parse -> execute;  
    3.     main -> init;  
    4.     main -> cleanup;  
    5.     execute -> make_string;  
    6.     execute -> printf  
    7.     init -> make_string;  
    8.     main -> printf;  
    9.     execute -> compare;  
    10. }  

    digraph指定该图是一个有向图(directed graph),->表示一条边,main,parse,execute等是顶点,运行出来的效果很好看,如下图:


    需要注意的是,我在这个dot脚本中没有指定任何的关于图的位置的信息,布局器会自动的根据图形的类型进行布局,并最终展现出来。

    再来看一个比较复杂,并且是程序员经常使用的功能,数据结构图:

    [c-sharp] view plaincopy
     
    1. digraph g {  
    2.     node [shape = record,height=.1];  
    3.     node0[label = "<f0> |<f1> G|<f2> "];  
    4.     node1[label = "<f0> |<f1> E|<f2> "];  
    5.     node2[label = "<f0> |<f1> B|<f2> "];  
    6.     node3[label = "<f0> |<f1> F|<f2> "];  
    7.     node4[label = "<f0> |<f1> R|<f2> "];  
    8.     node5[label = "<f0> |<f1> H|<f2> "];  
    9.     node6[label = "<f0> |<f1> Y|<f2> "];  
    10.     node7[label = "<f0> |<f1> A|<f2> "];  
    11.     node8[label = "<f0> |<f1> C|<f2> "];  
    12.     "node0":f2 -> "node4":f1;  
    13.     "node0":f0 -> "node1":f1;  
    14.     "node1":f0 -> "node2":f1;  
    15.     "node1":f2 -> "node3":f1;  
    16.     "node2":f2 -> "node8":f1;  
    17.     "node2":f0 -> "node7":f1;  
    18.     "node4":f2 -> "node6":f1;  
    19.     "node4":f0 -> "node5":f1;  
    20. }  

    运行后的效果如下图所示:

     

    不知道其他的程序员怎样,反正我对命令行情有独钟,比较喜欢这一类的工具。最早接触的计算机系统正是一个没有图形系统的BSD,由此对命令行的,没 有界面的程序都特别感兴趣。

    相关的想法

    自从使用了graphviz以后,一直想着把这个好东西移植到java下来,大概的思想跟graphviz类似:

    • 解析dot脚本,生成图的对象,这个图中包括节点,边以及子图等对象,这些对象上都绑定着相应的属性
    • 将解析出来的图对象发送给layout engine进行处理,layout engine可以选择布局策略,比如流布局等
    • 从layout engine中得到布局后的图对象,并交给image engine处理,得到最终结果,负责展示或者保存等

    dot 的语法定义比较简单,我已经用javacc构造了一个dot的分析器,现在可以从dot文件中构建出图对象出来,不过还需要进一步完善,可以看看这个 BNF定义:

    [c-sharp] view plaincopy
     
    1. graph -> [strict] (digraph|graph) id '{' stmt-list '}'  
    2. stmt-list -> [stmt [';'] [stmt-list] ]  
    3. stmt -> attr-stmt | node-stmt | edge-stmt | subgraph | id '=' id  
    4. attr-stmt -> (graph | node | edge) attr-list  
    5. attr-list -> '[' [a-list] ']' [attr-list]  
    6. a-list -> id '=' id [','][a-list]  
    7. node-stmt -> node-id [attr-list]  
    8. node-id -> id [port]  
    9. port -> port-location [port-angle] | port-angle [port-location]  
    10. port-location -> ':' id | ':' '(' id ',' id ')'  
    11. port-angle ->'@' id  
    12. edge-stmt -> (node-id | subgraph) edgeRHS [attr-list]  
    13. edgeRHS -> edgeop (node-id | subgraph) [edgeRHS]  
    14. subgraph -> [subgraph id] '{' stmt-list '}' | subgraph id  

    (最近老是感觉时间不够用,有很多有意思的项目要做,比如要完善前几天说的那个bbms(Bus Based Message Service), 再比如修改用Swing和Smack做一个jabber的客户端jTalk,都是很有搞头的,唉,扯远了。)

    当然graphviz的功能不至于此,它提供一个lib,可以用来将绘图引擎嵌入在自己的应用中。这是一个很有意义的事,我们可以不必掌握布局部分 的复杂算法,把精力放在业务逻辑部分,将最后的图对象交给这个引擎来处理即可。当然,如果你正好和我一样,想了解其神奇的布局算法,不妨翻翻它的源码,欢 迎交流之至。

    我在周末分析了下graphviz的内部结构,并建立了一个java的项目jraph ,用来做简单的移植,主要是学习之用,其实,Java的图库还是相当丰富的,比如JGraph ,JGraphT,Prefuse,TouchGraph等等,用来做项目当然是很便捷的,但是我还是比较喜欢看着一个算法被自己实现的过程,特别是这种 比较神奇的算法,哈哈。

    预期中的API如下:

    [c-sharp] view plaincopy
     
    1. public static void main(String[] args){  
    2.     Parser parser = new GCodeParser("file.g");  
    3.     GraphSet gs = parser.parse();  
    4.     GraphSet layouted =   
    5.         new GraphLayoutEngine(gs).layout();  
    6.     ImageEngine imgEngine =   
    7.         new GraphImageEngine(layouted);  
    8.     imgEngine.export(0);  
    9. }  

    同graphviz一样,先调用分析器构造出图的集合GraphSet(包括多个图,每个图中包括Vertex,Edge,及SubGraph), 然后进行布局,最后将通过布局后的GraphSet绘制结果。目前完成了框架的设计部分,分析器部分基本完成,layout部分只实现了一个策略,即force-based 布局算法,不过layout engine被设计成可以插拔的模型,如果有了新的算法实现,可以很容易的整合起来。

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/persist/p/3045988.html
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