评估指纹识别器可靠性的等级有三个：
1. 拒识率。是指实际匹配，但匹配器觉得不匹配的情况。实际上存在匹配时匹配器确定没有匹配的情况，当安全性不太重要，重要的是仅通过一次测量便可顺利登录时，用户需要较低的拒识率。
2. 误识率。是指实际不匹配，但匹配器误以为匹配的情况。实际上不存在匹配时匹配器确定存在匹配。当真正重要的是确信存在匹配时，您需要极低的误识率。
3. 交叉错误率。总体上，匹配器程序可加以调谐，以改善拒识率而牺牲误识率，或者反过来。为进行这两个操作，工程师必须改善匹配器程序或更改为本身更精确的匹配器程序类型（本质上相关匹配器优胜于细节匹配器，但比细节匹配器更大、更缓慢。）交叉错误率是误识率等同于拒识率的点。
随着匹配技术与传感器技术的发展，错误率一直在平稳地降低。总体而言，指纹识别器厂商将对软件进行调谐，以提高拒识率而降低误识率。其原因是如果使用者被错误的拒绝，使用者只要再次刷一下手指即可。但如果使用者被错误的通过验证，便能够访问其本应没有访问权的内容。
一次测量时，最新传感器的错误率为 3% 左右的拒识率和 1% 以下的误识率。即，随便一个人在他人的 PC 上滑动手指时，通过验证的几率不足 1%。对于 IBM 集成指纹识别器而言，进行三次指纹验证时，拒识率不足 0.5%。
已知的指纹识别器攻击有许多种。有些非常具有想象力，例如用弹道凝胶或软塑料等物体造一个假手指，将从玻璃上采集的指纹用胶带绑在该手指上，然后用它来触摸传感器。到现在为止，所有已知的现有攻击均针对触觉传感器。