链特异性转录组测序

链特异性转录组测序

2015年10月06日 21:50:56 xxxxy314 阅读数：1384更多

个人分类： Bioinformatic

 

常规转录组测序首先将mRNA片段化，然后采用随机引物进行cDNA双链的合成。因此，常规转录组在测序序列中不能提供链方向的特征信息，很难确定反义转录本，且不能真实的反映转录情况。

链特异性转录组测序（ssRNA-SEQ）是指在构建测序文库时，利用高保真Taq酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。与普通转录组测序相比，它更能准确地统计转录本的数量和确定基因的结构，同时可以发现更多的反义转录本，目前被广泛地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域范围。