存储引擎就是存储数据，建立索引，更新查询数据等等技术的实现方式。
存储引擎是基于表的，而不是基于库的。所以存储引擎也可被称为表类型。
Oracle，SqlServer等数据库只有一种存储引擎。MySQL提供了插件式的存储引擎架构。所以MySQL存在多种存储引擎，可以根据需要使用相应引擎，或者编写存储引擎。
1.1 InnoDB
从MySQL5.5.8，InnoDB成为MySQL默认的存储引擎。MySQL从3.23.34a开始支持InnoDB。
InnoDB支持事务，主要面向OLTP数据库应用。支持行锁，支持外键，并支持类似于Oracle的行锁定读，即默认读取操作不会产生锁。
InnoDB存储引擎中支持自动增长列AUTO_INCREMENT。自动增长列的值不能为空，且值必须唯一，且必须为主键。在执行插入操作时，若不指定自动增长列的值，或自动增长列的值为0或NULL，则插入的值为自动增长后的值。
若插入任意值，该值在该列中没有出现过，则可以直接插入。
InnoDB存储引擎中，创建的表的结构存储于.frm文件中。数据和索引存储在innodb_data_home和innodb_data_path表空间中。
对于表的数据存储，InnoDB存储引擎采用了聚集的方式，每张表的存储都是按主键顺序进行存放。若没有显示地在表定义时指定主键，InnoDB会为每一行生成一个6字节的ROWID，并以此作为主键。
InnoDB支持外键。外键所在的表为子表，外键依赖的表为父表。父表中被主表外键支持的字段必须为主键。当删除、更新浮标的某条信息时，子表也必须有相应的改变。
InnoDB通过多版本并发控制（MVCC）来获得高并发性，并实现了SQL标准的4种隔离机制，默认为REPEATABLE级别。同时使用一种被称为next-key locking的策略来避免幻读。InnoDB还提供了插入缓冲、二次写、自适应哈希索引、预读等高性能和高可用的功能。
1.2 MyISAM
MySQL5.5.8之前MyISAM是MySQL默认的存储引擎。
MyISAM不支持事务，不支持外键，支持全文索引，处理速度快。主要面向OLAP数据库应用。
MyISAM存储引擎的表存储成3个文件，文件名与表名相同，扩展名分别为：frm，MYD，MYI。
frm文件：存储表的结构。
myd文件：存储数据。
myi文件：存储存储索引。
MySQL 5.0版本之前，MyISAM默认支持的表大小为4GB，若需要支持大于4GB的MyISAM表时，则需要指定MAX_ROWS和AVG_ROW_LENGTH属性。从MySQL5.0开始，MyISAM默认支持256T的单表数据。
MyISAM的缓冲池只缓存索引文件，而不缓存数据文件。数据文件的缓存交给操作系统完成。这与大多数使用LRU算法缓存数据的数据库都不同。在MySQL5.1.23之前，无论32位系统或64位系统，缓存最大只能设置为4GB，在之后的版本中，64位的系统可以支持大于4GB的索引缓冲区。