在WinCE中支持两种类型的注册表：RAM-Based和HIVE-Based，默认情况下使用的是RAM-Based注册表。
1.RAM-Based注册表
RAM-Based的注册表是将所有的注册表数据存储在对象存储(object store)中，也就是存放在RAM里面。一般用在有电池备份RAM的系统上面，也就是说，当系统掉电以后，会自动切换成电池供电，此时RAM还有供电，所以上面的数据不会丢失，这样采用RAM-Based注册表非常有效。
RAM-Based注册表多用于经常热启动(Warm Boot)的设备上面，很少用在冷启动(Cold Boot)设备上面。
2.HIVE-Based注册表
HIVE-Based的注册表是将注册表数据存成文件，也就是存在掉电不会丢失数据的磁盘上面，HIVE注册表被分成两部分：系统Hive和用户Hive，也就是system.hv和user.hv。在一个多用户系统中，会包含多个用户Hive，不同的用户Hive(user.hv)会在该用户登陆的时候被加载，被注销的时候卸载。
实际上HIVE-Based的注册表包含三个部分，我称之为引导Hive，系统Hive和用户Hive，也就是Boot.hv，system.hv和user.hv。Boot.hv主要用于系统引导时候所需的注册表设置，这部分设置不会被保存在磁盘上面，也就是说，在系统掉电以后就会丢失。实际上，这部分应该说是属于RAM-Based注册表，由于这部分数据不需要改动，所以也就无所谓了。System.hv存放关于系统的注册表设置，user.hv存放和用户相关的注册表设置。
一般在我们编译WinCE系统的时候，Platform Builder会根据platform.reg文件中的注释标签来判断哪些注册表设置放入boot.hv中，凡是在注释标签”;HIVE BOOT SECTON”和”;END HIVE BOOT SECTION”之间的设置都会被放入boot.hv中，其他的都会放到default.hv和user.hv中。
在WinCE第一次引导的时候，所有的.hv都会被放到RAM中，WinCE系统会首先读取boot.hv进行相关引导时候的设置，然后把default.hv和user.hv放到磁盘的指定路径下面，这个路径也是在注册表中设置的，然后default.hv会被重命名为system.hv。当系统第二次启动的时候，会比较磁盘上的.hv和内存中的.hv是否一致，如果不一致，会拷贝磁盘上面的.hv到内存中。
我们可以看出，实际上HIVE注册表在运行的时候也是放在RAM中的，这样速度比较快。启动的时候会从磁盘上读出，在用户更改注册表以后，会被保存在磁盘上，保存的时机也是可以设置的，可以选择在用户更改后立刻保存到磁盘上，也可以选择在reboot的时候保存。