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  • (转)最长公共子序列

     动态规划解最长公共子序列问题

    动态规划法

    经常会遇到复杂问题不能简单地分解成几个子问题,而会分解出一系列的子问题。简单地采用把大问题分解成子问题,并综合子问题的解导出大问题的解的方法,问题求解耗时会按问题规模呈幂级数增加。

    为了节约重复求相同子问题的时间,引入一个数组,不管它们是否对最终解有用,把所有子问题的解存于该数组中,这就是动态规划法所采用的基本方法。 

    【问题】 求两字符序列的最长公共字符子序列

    问题描述:字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地(不一定连续)去掉若干个字符(可能一个也不去掉)后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0,x1,…,xm-1”,序列Y=“y0,y1,…,yk-1”是X的子序列,存在X的一个严格递增下标序列<i0,i1,…,ik-1>,使得对所有的j=0,1,…,k-1,有xij=yj。例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一个子序列。

    考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题,设A=“a0,a1,…,am-1”,B=“b0,b1,…,bm-1”,并Z=“z0,z1,…,zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质:

    (1) 如果am-1=bn-1,则zk-1=am-1=bn-1,且“z0,z1,…,zk-2”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列;

    (2) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=am-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列;

    (3) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=bn-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列。

    这样,在找A和B的公共子序列时,如有am-1=bn-1,则进一步解决一个子问题,找“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bm-2”的一个最长公共子序列;如果am-1!=bn-1,则要解决两个子问题,找出“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列,再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。 

    【求解】 

    引进一个二维数组c[][],用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度,b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的,以决定搜索的方向。
    我们是自底向上进行递推计算,那么在计算c[i,j]之前,c[i-1][j-1],c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j],就可以计算出c[i][j]。

    问题的递归式写成:

    recursive formula

    回溯输出最长公共子序列过程:

    flow

    【算法分析】
    由于每次调用至少向上或向左(或向上向左同时)移动一步,故最多调用(m + n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况,此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反,步数相同,故算法时间复杂度为Θ(m + n)。

    【代码实例】

    package wrc.zchy.code;
    
    
    /**
     * 最长公共子序列。经典DP问题。
     * 动态规划:本质上是一种 划分自问题算法。任何DP算法都是基于存储的算法,核心是状态转换方程。任何子问题的提出
     * 都要依赖于现有的类似结论,而当前子问题的结论是为后面问题的求解铺垫。
     * @author wrencai
     *
     */
    public class LCSubsequence {
    
        /**
         * 求两个字符串的公共【子序列】。
         * @param str1
         * @param str2
         * @return
         */
        static String LCS(String str1 , String str2){
             int[][] dp = LCS_DP(str1 , str2);
             int m = dp.length - 1 , n = dp[0].length -1;
             char[] lcs = new char[dp[m][n]];
             int c = lcs.length-1;
             while(c >= 0){
                 if(dp[m][n] > dp[m-1][n] && dp[m][n] > dp[m][n-1]){
                     lcs[c--] = str1.charAt(m-1);
                     m--;
                     n--;
                 } else if(dp[m][n] == dp[m-1][n])
                     m--;
                 else
                     n--;
             }
             return String.valueOf(lcs);
        }
        /**
         * 求dp[m+1][n+1]矩阵,str1长度m,str2长度n,dp[i][k]表示str1[0..i]和str2[0..k]两个子串之间的最长公共
         * 子序列长度。
         * @param str1 
         * @param str2
         * @return
         */
        static int[][] LCS_DP(String str1 , String str2){
            int m = str1.length()  , n = str2.length();
            int[][] dp = new int[m+1][n+1];
            for(int i = 0 ; i < dp.length ; i ++)
                dp[i] = new int[n+1];
            
            // 计算dp数组
            for(int i = 1 ; i < dp.length ; i++)
                for(int k = 1 ; k < dp[0].length ; k++){
                    if(str1.charAt(i-1) == str2.charAt(k-1))
                        dp[i][k] = dp[i-1][k-1] + 1;
                    else if(dp[i-1][k] >= dp[i][k-1])
                        dp[i][k] = dp[i-1][k];
                    else
                        dp[i][k] = dp[i][k-1];
                }
            return dp;        
        }
        
        
        public static void main(String[] args) {
            String str1 = "ABCBDAB";
            String str2 = "BDCABA";
            int[][] dp = LCS_DP(str1,str2);
            for(int i = 0 ; i < dp.length ; i++){
                for(int k = 0 ; k < dp[0].length ; k++)
                    System.out.print(dp[i][k]+",");
                System.out.println("");
            }
            System.out.println(LCS(str1,str2));
        }//end function main
    
    }
     
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