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  • 利用DSB2017冠军开源代码为LUNA16生成mask

    代码地址:https://github.com/lfz/DSB2017

    先展示下生成的mask与真实mask

    subset9                                                                     

    subset8

    subset7

    subset6                       

    subset5

    subset4

     subset3              

     

    subset2

    subset1

    上面的图片是从subset1~subset9中随机选取的切片,左边为生成的mask,右边为ground truth,效果相当不错,不过仍有瑕疵,比如说subset3的mask就明显少了一大块。

    在DSB2017中其实利用了两部分数据,一部分是比赛方提供的数据,一部分是LUNA16数据集,LUNA16数据集提供了mask,所以代码中是分开处理的,对于LUNA16利用提供的mask,对于比赛数据,采用阈值化加形态学操作,生成mask,那么这个mask有啥用呢,是用来剔除与肺部无关的区域,便于肺结节检测。

    DSB2017中具体生成的mask的文件是preprocessing/step1.py。

    作为替代方案,其实也可以采用CNN来进行分割,产生mask,而且效果应该会更好。

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