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  • 【tensorflow2.0】数据管道dataset

    如果需要训练的数据大小不大,例如不到1G,那么可以直接全部读入内存中进行训练,这样一般效率最高。

    但如果需要训练的数据很大,例如超过10G,无法一次载入内存,那么通常需要在训练的过程中分批逐渐读入。

    使用 tf.data API 可以构建数据输入管道,轻松处理大量的数据,不同的数据格式,以及不同的数据转换。

    一,构建数据管道

    可以从 Numpy array, Pandas DataFrame, Python generator, csv文件, 文本文件, 文件路径, tfrecords文件等方式构建数据管道。

    其中通过Numpy array, Pandas DataFrame, 文件路径构建数据管道是最常用的方法。

    通过tfrecords文件方式构建数据管道较为复杂,需要对样本构建tf.Example后压缩成字符串写到tfrecoreds文件,读取后再解析成tf.Example。

    但tfrecoreds文件的优点是压缩后文件较小,便于网络传播,加载速度较快。

    首先看下iris部分数据:

    'feature_names': ['sepal length (cm)',
      'sepal width (cm)',
      'petal length (cm)',
      'petal width (cm)'],
     'filename': '/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/sklearn/datasets/data/iris.csv',
     'target': array([0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
            0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
            0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
            1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
            1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
            2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
            2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2]),
     'target_names': array(['setosa', 'versicolor', 'virginica'], dtype='<U10')

    1,从Numpy array构建数据管道

    # 从Numpy array构建数据管道
     
    import tensorflow as tf
    import numpy as np 
    from sklearn import datasets 
    iris = datasets.load_iris()
     
     
    ds1 = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((iris["data"],iris["target"]))
    for features,label in ds1.take(5):
        print(features,label)
    tf.Tensor([5.1 3.5 1.4 0.2], shape=(4,), dtype=float64) tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor([4.9 3.  1.4 0.2], shape=(4,), dtype=float64) tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor([4.7 3.2 1.3 0.2], shape=(4,), dtype=float64) tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor([4.6 3.1 1.5 0.2], shape=(4,), dtype=float64) tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor([5.  3.6 1.4 0.2], shape=(4,), dtype=float64) tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64

    2,从 Pandas DataFrame构建数据管道

    # 从 Pandas DataFrame构建数据管道
    import tensorflow as tf
    from sklearn import datasets 
    import pandas as pd
    iris = datasets.load_iris()
    dfiris = pd.DataFrame(iris["data"],columns = iris.feature_names)
    ds2 = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((dfiris.to_dict("list"),iris["target"]))
     
    for features,label in ds2.take(3):
        print(features,label)
    {'sepal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=5.1>, 'sepal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=3.5>, 'petal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=1.4>, 'petal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=0.2>} tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    {'sepal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=4.9>, 'sepal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=3.0>, 'petal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=1.4>, 'petal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=0.2>} tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    {'sepal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=4.7>, 'sepal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=3.2>, 'petal length (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=1.3>, 'petal width (cm)': <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=0.2>} tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)

    3,从Python generator构建数据管道

    # 从Python generator构建数据管道
    import tensorflow as tf
    from matplotlib import pyplot as plt 
    from tensorflow.keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator
     
    # 定义一个从文件中读取图片的generator
    image_generator = ImageDataGenerator(rescale=1.0/255).flow_from_directory(
                        "./data/cifar2/test/",
                        target_size=(32, 32),
                        batch_size=20,
                        class_mode='binary')
     
    classdict = image_generator.class_indices
    print(classdict)

    Found 2000 images

    belonging to 2 classes. {'airplane': 0, 'automobile': 1}

    def generator():
        for features,label in image_generator:
            yield (features,label)
     
    ds3 = tf.data.Dataset.from_generator(generator,output_types=(tf.float32,tf.int32))
    %matplotlib inline
    %config InlineBackend.figure_format = 'svg'
    plt.figure(figsize=(6,6)) 
    for i,(img,label) in enumerate(ds3.unbatch().take(9)):
        ax=plt.subplot(3,3,i+1)
        ax.imshow(img.numpy())
        ax.set_title("label = %d"%label)
        ax.set_xticks([])
        ax.set_yticks([]) 
    plt.show()

    4,从csv文件构建数据管道

    # 从csv文件构建数据管道
    ds4 = tf.data.experimental.make_csv_dataset(
          file_pattern = ["./data/titanic/train.csv","./data/titanic/test.csv"],
          batch_size=3, 
          label_name="Survived",
          na_value="",
          num_epochs=1,
          ignore_errors=True)
     
    for data,label in ds4.take(2):
        print(data,label)
    OrderedDict([('PassengerId', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([540,  58, 764], dtype=int32)>), ('Pclass', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([1, 3, 1], dtype=int32)>), ('Name', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=
    array([b'Frolicher, Miss. Hedwig Margaritha', b'Novel, Mr. Mansouer',
           b'Carter, Mrs. William Ernest (Lucile Polk)'], dtype=object)>), ('Sex', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'female', b'male', b'female'], dtype=object)>), ('Age', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=float32, numpy=array([22. , 28.5, 36. ], dtype=float32)>), ('SibSp', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([0, 0, 1], dtype=int32)>), ('Parch', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([2, 0, 2], dtype=int32)>), ('Ticket', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'13568', b'2697', b'113760'], dtype=object)>), ('Fare', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=float32, numpy=array([ 49.5   ,   7.2292, 120.    ], dtype=float32)>), ('Cabin', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'B39', b'', b'B96 B98'], dtype=object)>), ('Embarked', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'C', b'C', b'S'], dtype=object)>)]) tf.Tensor([1 0 1], shape=(3,), dtype=int32)
    OrderedDict([('PassengerId', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([845,  66, 390], dtype=int32)>), ('Pclass', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([3, 3, 2], dtype=int32)>), ('Name', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=
    array([b'Culumovic, Mr. Jeso', b'Moubarek, Master. Gerios',
           b'Lehmann, Miss. Bertha'], dtype=object)>), ('Sex', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'male', b'male', b'female'], dtype=object)>), ('Age', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=float32, numpy=array([17.,  0., 17.], dtype=float32)>), ('SibSp', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([0, 1, 0], dtype=int32)>), ('Parch', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=int32, numpy=array([0, 1, 0], dtype=int32)>), ('Ticket', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'315090', b'2661', b'SC 1748'], dtype=object)>), ('Fare', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=float32, numpy=array([ 8.6625, 15.2458, 12.    ], dtype=float32)>), ('Cabin', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'', b'', b''], dtype=object)>), ('Embarked', <tf.Tensor: shape=(3,), dtype=string, numpy=array([b'S', b'C', b'C'], dtype=object)>)]) tf.Tensor([0 1 1], shape=(3,), dtype=int32)

    5,从文本文件构建数据管道

    # 从文本文件构建数据管道
     
    ds5 = tf.data.TextLineDataset(
        filenames = ["./data/titanic/train.csv","./data/titanic/test.csv"]
        ).skip(1) #略去第一行header
     
    for line in ds5.take(5):
        print(line)
    tf.Tensor(b'493,0,1,"Molson, Mr. Harry Markland",male,55.0,0,0,113787,30.5,C30,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'53,1,1,"Harper, Mrs. Henry Sleeper (Myna Haxtun)",female,49.0,1,0,PC 17572,76.7292,D33,C', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'388,1,2,"Buss, Miss. Kate",female,36.0,0,0,27849,13.0,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'192,0,2,"Carbines, Mr. William",male,19.0,0,0,28424,13.0,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'687,0,3,"Panula, Mr. Jaako Arnold",male,14.0,4,1,3101295,39.6875,,S', shape=(), dtype=string)

    6,从文件路径构建数据管道

    s6 = tf.data.Dataset.list_files("./data/cifar2/train/*/*.jpg")
    for file in ds6.take(5):
        print(file)
    tf.Tensor(b'./data/cifar2/train/automobile/1263.jpg', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'./data/cifar2/train/airplane/2837.jpg', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'./data/cifar2/train/airplane/4264.jpg', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'./data/cifar2/train/automobile/4241.jpg', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'./data/cifar2/train/automobile/192.jpg', shape=(), dtype=string)
    from matplotlib import pyplot as plt 
    def load_image(img_path,size = (32,32)):
        label = 1 if tf.strings.regex_full_match(img_path,".*/automobile/.*") else 0
        img = tf.io.read_file(img_path)
        img = tf.image.decode_jpeg(img) #注意此处为jpeg格式
        img = tf.image.resize(img,size)
        return(img,label)
     
    %matplotlib inline
    %config InlineBackend.figure_format = 'svg'
    for i,(img,label) in enumerate(ds6.map(load_image).take(2)):
        plt.figure(i)
        plt.imshow((img/255.0).numpy())
        plt.title("label = %d"%label)
        plt.xticks([])
        plt.yticks([])

    7,从tfrecords文件构建数据管道

    import os
    import numpy as np
     
    # inpath:原始数据路径 outpath:TFRecord文件输出路径
    def create_tfrecords(inpath,outpath): 
        writer = tf.io.TFRecordWriter(outpath)
        dirs = os.listdir(inpath)
        for index, name in enumerate(dirs):
            class_path = inpath +"/"+ name+"/"
            for img_name in os.listdir(class_path):
                img_path = class_path + img_name
                img = tf.io.read_file(img_path)
                #img = tf.image.decode_image(img)
                #img = tf.image.encode_jpeg(img) #统一成jpeg格式压缩
                example = tf.train.Example(
                   features=tf.train.Features(feature={
                        'label': tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[index])),
                        'img_raw': tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[img.numpy()]))
                   }))
                writer.write(example.SerializeToString())
        writer.close()
     
    create_tfrecords("./data/cifar2/test/","./data/cifar2_test.tfrecords/")
     
    from matplotlib import pyplot as plt 
     
    def parse_example(proto):
        description ={ 'img_raw' : tf.io.FixedLenFeature([], tf.string),
                       'label': tf.io.FixedLenFeature([], tf.int64)} 
        example = tf.io.parse_single_example(proto, description)
        img = tf.image.decode_jpeg(example["img_raw"])   #注意此处为jpeg格式
        img = tf.image.resize(img, (32,32))
        label = example["label"]
        return(img,label)
     
    ds7 = tf.data.TFRecordDataset("./data/cifar2_test.tfrecords").map(parse_example).shuffle(3000)
     
    %matplotlib inline
    %config InlineBackend.figure_format = 'svg'
    plt.figure(figsize=(6,6)) 
    for i,(img,label) in enumerate(ds7.take(9)):
        ax=plt.subplot(3,3,i+1)
        ax.imshow((img/255.0).numpy())
        ax.set_title("label = %d"%label)
        ax.set_xticks([])
        ax.set_yticks([]) 
    plt.show()

    二,应用数据转换

    Dataset数据结构应用非常灵活,因为它本质上是一个Sequece序列,其每个元素可以是各种类型,例如可以是张量,列表,字典,也可以是Dataset。

    Dataset包含了非常丰富的数据转换功能。

    • map: 将转换函数映射到数据集每一个元素。

    • flat_map: 将转换函数映射到数据集的每一个元素,并将嵌套的Dataset压平。

    • interleave: 效果类似flat_map,但可以将不同来源的数据夹在一起。

    • filter: 过滤掉某些元素。

    • zip: 将两个长度相同的Dataset横向铰合。

    • concatenate: 将两个Dataset纵向连接。

    • reduce: 执行归并操作。

    • batch : 构建批次,每次放一个批次。比原始数据增加一个维度。 其逆操作为unbatch。

    • padded_batch: 构建批次,类似batch, 但可以填充到相同的形状。

    • window :构建滑动窗口,返回Dataset of Dataset.

    • shuffle: 数据顺序洗牌。

    • repeat: 重复数据若干次,不带参数时,重复无数次。

    • shard: 采样,从某个位置开始隔固定距离采样一个元素。

    • take: 采样,从开始位置取前几个元素。
    # map:将转换函数映射到数据集每一个元素
     
    ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(["hello world","hello China","hello Beijing"])
    ds_map = ds.map(lambda x:tf.strings.split(x," "))
    for x in ds_map:
        print(x)
    tf.Tensor([b'hello' b'world'], shape=(2,), dtype=string)
    tf.Tensor([b'hello' b'China'], shape=(2,), dtype=string)
    tf.Tensor([b'hello' b'Beijing'], shape=(2,), dtype=string)
    # flat_map:将转换函数映射到数据集的每一个元素,并将嵌套的Dataset压平。
     
    ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(["hello world","hello China","hello Beijing"])
    ds_flatmap = ds.flat_map(lambda x:tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.strings.split(x," ")))
    for x in ds_flatmap:
        print(x)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'world', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'China', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'Beijing', shape=(), dtype=string)
    # interleave: 效果类似flat_map,但可以将不同来源的数据夹在一起。
     
    ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(["hello world","hello China","hello Beijing"])
    ds_interleave = ds.interleave(lambda x:tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.strings.split(x," ")))
    for x in ds_interleave:
        print(x)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'hello', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'world', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'China', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'Beijing', shape=(), dtype=string)
    # filter:过滤掉某些元素。
     
    ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(["hello world","hello China","hello Beijing"])
    # 找出含有字母a或B的元素
    ds_filter = ds.filter(lambda x: tf.strings.regex_full_match(x, ".*[a|B].*"))
    for x in ds_filter:
        print(x)
    tf.Tensor(b'hello China', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'hello Beijing', shape=(), dtype=string)
    # zip:将两个长度相同的Dataset横向铰合。
     
    ds1 = tf.data.Dataset.range(0,3)
    ds2 = tf.data.Dataset.range(3,6)
    ds3 = tf.data.Dataset.range(6,9)
    ds_zip = tf.data.Dataset.zip((ds1,ds2,ds3))
    for x,y,z in ds_zip:
        print(x.numpy(),y.numpy(),z.numpy())
    0 3 6
    1 4 7
    2 5 8
    # condatenate:将两个Dataset纵向连接。
     
    ds1 = tf.data.Dataset.range(0,3)
    ds2 = tf.data.Dataset.range(3,6)
    ds_concat = tf.data.Dataset.concatenate(ds1,ds2)
    for x in ds_concat:
        print(x)
    tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(2, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(3, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(4, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(5, shape=(), dtype=int64)
    # reduce:执行归并操作。
     
    ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices([1,2,3,4,5.0])
    result = ds.reduce(0.0,lambda x,y:tf.add(x,y))
    result
    <tf.Tensor: shape=(), dtype=float32, numpy=15.0>
    # batch:构建批次,每次放一个批次。比原始数据增加一个维度。 其逆操作为unbatch。 
     
    ds = tf.data.Dataset.range(12)
    ds_batch = ds.batch(4)
    for x in ds_batch:
        print(x)
    tf.Tensor([0 1 2 3], shape=(4,), dtype=int64)
    tf.Tensor([4 5 6 7], shape=(4,), dtype=int64)
    tf.Tensor([ 8  9 10 11], shape=(4,), dtype=int64)
    # padded_batch:构建批次,类似batch, 但可以填充到相同的形状。
     
    elements = [[1, 2],[3, 4, 5],[6, 7],[8]]
    ds = tf.data.Dataset.from_generator(lambda: iter(elements), tf.int32)
     
    ds_padded_batch = ds.padded_batch(2,padded_shapes = [4,])
    for x in ds_padded_batch:
        print(x)
    tf.Tensor(
    [[1 2 0 0]
     [3 4 5 0]], shape=(2, 4), dtype=int32)
    tf.Tensor(
    [[6 7 0 0]
     [8 0 0 0]], shape=(2, 4), dtype=int32)
    # window:构建滑动窗口,返回Dataset of Dataset.
     
    ds = tf.data.Dataset.range(12)
    # window返回的是Dataset of Dataset,可以用flat_map压平
    ds_window = ds.window(3, shift=1).flat_map(lambda x: x.batch(3,drop_remainder=True)) 
    for x in ds_window:
        print(x)
    tf.Tensor([0 1 2], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([1 2 3], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([2 3 4], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([3 4 5], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([4 5 6], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([5 6 7], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([6 7 8], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([7 8 9], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([ 8  9 10], shape=(3,), dtype=int64)
    tf.Tensor([ 9 10 11], shape=(3,), dtype=int64)
    # shuffle:数据顺序洗牌。
     
    ds = tf.data.Dataset.range(12)
    ds_shuffle = ds.shuffle(buffer_size = 5)
    for x in ds_shuffle:
        print(x)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(4, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(6, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(5, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(2, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(7, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(11, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(3, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(9, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(10, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(8, shape=(), dtype=int64)
    # repeat:重复数据若干次,不带参数时,重复无数次。
     
    ds = tf.data.Dataset.range(3)
    ds_repeat = ds.repeat(3)
    for x in ds_repeat:
        print(x)
    tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(2, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(2, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(0, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(2, shape=(), dtype=int64)
    # shard:采样,从某个位置开始隔固定距离采样一个元素。
     
    ds = tf.data.Dataset.range(12)
    ds_shard = ds.shard(3,index = 1)
     
    for x in ds_shard:
        print(x)
    tf.Tensor(1, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(4, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(7, shape=(), dtype=int64)
    tf.Tensor(10, shape=(), dtype=int64)
    # take:采样,从开始位置取前几个元素。
     
    ds = tf.data.Dataset.range(12)
    ds_take = ds.take(3)
     
    list(ds_take.as_numpy_iterator())
    [0, 1, 2]

    三,提升管道性能

    训练深度学习模型常常会非常耗时。

    模型训练的耗时主要来自于两个部分,一部分来自数据准备,另一部分来自参数迭代

    参数迭代过程的耗时通常依赖于GPU来提升。

    而数据准备过程的耗时则可以通过构建高效的数据管道进行提升。

    以下是一些构建高效数据管道的建议。

    • 1,使用 prefetch 方法让数据准备和参数迭代两个过程相互并行。

    • 2,使用 interleave 方法可以让数据读取过程多进程执行,并将不同来源数据夹在一起。

    • 3,使用 map 时设置num_parallel_calls 让数据转换过程多进行执行。

    • 4,使用 cache 方法让数据在第一个epoch后缓存到内存中,仅限于数据集不大情形。

    • 5,使用 map转换时,先batch, 然后采用向量化的转换方法对每个batch进行转换。

    1,使用 prefetch 方法让数据准备和参数迭代两个过程相互并行。

    import tensorflow as tf
     
    # 打印时间分割线
    @tf.function
    def printbar():
        ts = tf.timestamp()
        today_ts = ts%(24*60*60)
     
        hour = tf.cast(today_ts//3600+8,tf.int32)%tf.constant(24)
        minite = tf.cast((today_ts%3600)//60,tf.int32)
        second = tf.cast(tf.floor(today_ts%60),tf.int32)
     
        def timeformat(m):
            if tf.strings.length(tf.strings.format("{}",m))==1:
                return(tf.strings.format("0{}",m))
            else:
                return(tf.strings.format("{}",m))
     
        timestring = tf.strings.join([timeformat(hour),timeformat(minite),
                    timeformat(second)],separator = ":")
        tf.print("=========="*8,end = "")
        tf.print(timestring)
     
    import time
     
    # 数据准备和参数迭代两个过程默认情况下是串行的。
     
    # 模拟数据准备
    def generator():
        for i in range(10):
            #假设每次准备数据需要2s
            time.sleep(2) 
            yield i 
    ds = tf.data.Dataset.from_generator(generator,output_types = (tf.int32))
     
    # 模拟参数迭代
    def train_step():
        #假设每一步训练需要1s
        time.sleep(1) 
     
    # 训练过程预计耗时 10*2+10*1+ = 30s
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start training..."))
    for x in ds:
        train_step()  
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end training..."))
    # 使用 prefetch 方法让数据准备和参数迭代两个过程相互并行。
     
    # 训练过程预计耗时 max(10*2,10*1) = 20s
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start training with prefetch..."))
     
    # tf.data.experimental.AUTOTUNE 可以让程序自动选择合适的参数
    for x in ds.prefetch(buffer_size = tf.data.experimental.AUTOTUNE):
        train_step()  
     
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end training..."))
    ================================================================================16:18:31
    start training...
    ================================================================================16:19:01
    end training...
    ================================================================================16:19:01
    start training with prefetch...
    ================================================================================16:19:23
    end training...

    2,使用 interleave 方法可以让数据读取过程多进程执行,并将不同来源数据夹在一起。

    ds_files = tf.data.Dataset.list_files("./data/titanic/*.csv")
    ds = ds_files.flat_map(lambda x:tf.data.TextLineDataset(x).skip(1))
    for line in ds.take(4):
        print(line)
    tf.Tensor(b'493,0,1,"Molson, Mr. Harry Markland",male,55.0,0,0,113787,30.5,C30,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'53,1,1,"Harper, Mrs. Henry Sleeper (Myna Haxtun)",female,49.0,1,0,PC 17572,76.7292,D33,C', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'388,1,2,"Buss, Miss. Kate",female,36.0,0,0,27849,13.0,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'192,0,2,"Carbines, Mr. William",male,19.0,0,0,28424,13.0,,S', shape=(), dtype=string)
    ds_files = tf.data.Dataset.list_files("./data/titanic/*.csv")
    ds = ds_files.interleave(lambda x:tf.data.TextLineDataset(x).skip(1))
    for line in ds.take(8):
        print(line)
    tf.Tensor(b'181,0,3,"Sage, Miss. Constance Gladys",female,,8,2,CA. 2343,69.55,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'493,0,1,"Molson, Mr. Harry Markland",male,55.0,0,0,113787,30.5,C30,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'405,0,3,"Oreskovic, Miss. Marija",female,20.0,0,0,315096,8.6625,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'53,1,1,"Harper, Mrs. Henry Sleeper (Myna Haxtun)",female,49.0,1,0,PC 17572,76.7292,D33,C', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'635,0,3,"Skoog, Miss. Mabel",female,9.0,3,2,347088,27.9,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'388,1,2,"Buss, Miss. Kate",female,36.0,0,0,27849,13.0,,S', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'701,1,1,"Astor, Mrs. John Jacob (Madeleine Talmadge Force)",female,18.0,1,0,PC 17757,227.525,C62 C64,C', shape=(), dtype=string)
    tf.Tensor(b'192,0,2,"Carbines, Mr. William",male,19.0,0,0,28424,13.0,,S', shape=(), dtype=string)

    3,使用 map 时设置num_parallel_calls 让数据转换过程多进行执行

    ds = tf.data.Dataset.list_files("./data/cifar2/train/*/*.jpg")
    def load_image(img_path,size = (32,32)):
        label = 1 if tf.strings.regex_full_match(img_path,".*/automobile/.*") else 0
        img = tf.io.read_file(img_path)
        img = tf.image.decode_jpeg(img) #注意此处为jpeg格式
        img = tf.image.resize(img,size)
        return(img,label)
    # 单进程转换
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start transformation..."))
     
    ds_map = ds.map(load_image)
    for _ in ds_map:
        pass
     
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end transformation..."))
    # 多进程转换
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start parallel transformation..."))
     
    ds_map_parallel = ds.map(load_image,num_parallel_calls = tf.data.experimental.AUTOTUNE)
    for _ in ds_map_parallel:
        pass
     
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end parallel transformation..."))

    4,使用 cache 方法让数据在第一个epoch后缓存到内存中,仅限于数据集不大情形。

    import time
     
    # 模拟数据准备
    def generator():
        for i in range(5):
            #假设每次准备数据需要2s
            time.sleep(2) 
            yield i 
    ds = tf.data.Dataset.from_generator(generator,output_types = (tf.int32))
     
    # 模拟参数迭代
    def train_step():
        #假设每一步训练需要0s
        pass
     
    # 训练过程预计耗时 (5*2+5*0)*3 = 30s
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start training..."))
    for epoch in tf.range(3):
        for x in ds:
            train_step()  
        printbar()
        tf.print("epoch =",epoch," ended")
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end training..."))
     
    import time
     
    # 模拟数据准备
    def generator():
        for i in range(5):
            #假设每次准备数据需要2s
            time.sleep(2) 
            yield i 
     
    # 使用 cache 方法让数据在第一个epoch后缓存到内存中,仅限于数据集不大情形。
    ds = tf.data.Dataset.from_generator(generator,output_types = (tf.int32)).cache()
     
    # 模拟参数迭代
    def train_step():
        #假设每一步训练需要0s
        time.sleep(0) 
     
    # 训练过程预计耗时 (5*2+5*0)+(5*0+5*0)*2 = 10s
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start training..."))
    for epoch in tf.range(3):
        for x in ds:
            train_step()  
        printbar()
        tf.print("epoch =",epoch," ended")
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end training..."))
    ================================================================================17:07:57
    start training...
    ================================================================================17:08:07
    epoch = 0  ended
    ================================================================================17:08:17
    epoch = 1  ended
    ================================================================================17:08:27
    epoch = 2  ended
    ================================================================================17:08:27
    end training...
    ================================================================================17:08:27
    start training...
    ================================================================================17:08:37
    epoch = 0  ended
    ================================================================================17:08:37
    epoch = 1  ended
    ================================================================================17:08:37
    epoch = 2  ended
    ================================================================================17:08:37
    end training...

    5,使用 map转换时,先batch, 然后采用向量化的转换方法对每个batch进行转换。

    # 先map后batch
    ds = tf.data.Dataset.range(100000)
    ds_map_batch = ds.map(lambda x:x**2).batch(20)
     
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start scalar transformation..."))
    for x in ds_map_batch:
        pass
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end scalar transformation..."))
     
    # 先batch后map
    ds = tf.data.Dataset.range(100000)
    ds_batch_map = ds.batch(20).map(lambda x:x**2)
     
    printbar()
    tf.print(tf.constant("start vector transformation..."))
    for x in ds_batch_map:
        pass
    printbar()
    tf.print(tf.constant("end vector transformation..."))
    ================================================================================17:09:10
    start scalar transformation...
    ================================================================================17:09:13
    end scalar transformation...
    ================================================================================17:09:13
    start vector transformation...
    ================================================================================17:09:14
    end vector transformation...

    参考:

    开源电子书地址:https://lyhue1991.github.io/eat_tensorflow2_in_30_days/

    GitHub 项目地址:https://github.com/lyhue1991/eat_tensorflow2_in_30_days

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